前言 转录组

Posted 2020-12-30 yahengwang

转录组

　　转录组（Transcriptome），广义上指在相同环境（或生理条件）下的一个细胞、或一群细胞中所能转录出的所有RNA的总和，包括 信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）以及非编码RNA（ncRNA）；狭义上则指转录出的信使RNA（mRNA）。

转录组学

　　转录组学(Transcriptomics),是分子生物学的一个分支,研究在单个细胞或特定类型细胞/组织/器官或发育阶段的细胞群内所生产的各类RNA分子的类型和数量。

　　转录组测定的是样本表达的基因丰度及其类型（例如，可变剪切）。每个细胞里面的每一种mRNA分子的平均数称为该种mRNA的丰度，根据丰度可把mRNA群体分为两大类：

1. 高丰度mRNA，通常由细胞里不到100种的mRNA（每种mRNA分子拷贝数为1000~10000）组成，占总mRNA的50%左右。

2. 稀有mNRA，或复杂mRNA，由长度不等的种类繁多的序列组成，每种序列只有少量的拷贝。

　　高丰度mRNA在不同类型细胞中有很大区别。例如，卵清蛋白只在输卵管细胞里合成而不在肝脏内合成，其mRNA占输卵管细胞mRNA总量的一半，但高丰度mRNA只占基因表达数的很小一部分。

　　稀有mRNA大部分是许多，甚至是所有类型细胞所共有的，包括了各种类型细胞所需的功能。编码这种类型的功能的基因，有时被称为“持家基因”或“组成型基因”，；编码特定细胞特定功能的基因，称为“奢侈基因”。

研究方法

1. DNA微阵列技术（又名，基因芯片）

2. RNA测序

应用

• 干细胞和癌细胞转录组研究可以帮助研究人员了解细胞分化和癌变过程

• 分析人类卵母细胞和胚胎的转录组用于了解控制早期胚胎发育的分子机制和信号通路，理论上可以成为在体外人工受精中进行适当胚胎选择的有力工具

• 用于新药研究或化学品的安全性风险评估

• 推断系统发育关系

参考资料

转录组