病毒感染检测 (15分) 人的DNA和病毒DNA均表示成由一些字母组成的字符串序列。然后检测某种病毒DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过，如果出现过，则此人感染了该病毒，否则没有感染。

Posted 2020-12-08 xy2656141474

 1  #include<iostream>
 2  #include<cstring>
 3 //.size()的头文件 
 4  using namespace std;
 5  
 6  int next1[1000005];
 7 void getnext(string t ,int tsize)//从0号下标开始存起 
 8  {
 9      int len = -1 ;
10      int j = 0;
11      next1[0] = -1;
12      while(j<tsize-1)
13      {
14          if(len==-1||t[j] == t[len])
15          {
16              ++j;
17              ++len;
18              next1[j] = len;
19 //             cout<<next1[j]<<" "; 
20          }else
21          len = next1[len];
22      }
23  } 
24  
25  int kmp(string s ,string t ,int ssize,int tsize)//字符串都是从0号下标开始存起 
26  {
27      int i = 0 ; 
28      int j = 0 ;
29      while(i<ssize&&j<tsize)
30      {
31        if(j==-1||s[i]==t[j])
32          {
33              i++;
34              j++;
35          }
36          else
37          {
38              j = next1[j];
39          }
40      }
41      if(j==tsize)
42      {
43         return i-j+1;
44      }else
45      return -1;
46  }
47  
48  int n ;
49  int ssize;
50  int tsize;
51  int ans ;
52  int main()
53  {
54      int flag = 0;
55      char s[100000]={0},t[100000] = {0},temp_tt[10000] = {0};
56 
57      cin>>n;             //输入要检测的病毒串和人串
58      while(n--)
59      {
60           
61          cin>>t;    //病毒序列
62          tsize = strlen(t);         
63         
64         for(int i = 0;i<tsize;i++)//把子串加倍：病毒是环状的 
65         {
66             t[tsize+i] = t[i];
67         }
68         t[tsize*2] = ‘‘;
69          
70          cin>>s;//人体的字符串
71          ssize = strlen(s);
72          
73          for(int j = 0;j<tsize;j++)
74          {
75              string temp = t;
76             temp.copy(temp_tt, tsize, j); //把加倍的字符串temp切片：切为长度为tsize，起点下标为j的字符数组,并把他放在temp_tt中 
77              getnext(temp_tt,tsize);
78              ans = kmp(s,temp_tt,ssize,tsize);  //用一个ans来记录是否找到匹配
79          if(ans!=-1)   //找到
80              {
81                  flag++;
82                    break;
83             }         
84          }
85        if(!flag)
86              cout<<"NO"<<endl;
87          else
88              cout<<"YES"<<endl;    
89         flag = 0; 
90      }
91      return 0;
92  }