temp1

Posted qiniqnyang

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了temp1相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1.从bam文件中提取位点的测序深度

samtools depth -b intervals.bed 1.bam 

 

intervals.bed文件包括需要提取的位点

chr1 39717581

chr1 39898741

chr1 40928207

chr1 91405097

chr1 99225626

chr1 150812033

chr1 155448184

chr1 160098527

 

2.提取所有位点的ref_depth和var_depth

以上是关于temp1的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章