ggplot2 Manhattan Plots
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了ggplot2 Manhattan Plots相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
最经典的一种genome wide图形,可以显示全基因组的hit。
GWAS的数据
需要里面的Chr,start,bp_cum,以及最核心的p-value。
我准备的CRIPSR screen数据。
参考:
- How I Create Manhattan Plots Using ggplot
- http://localhost:17435/notebooks/tmpData/ApcKO_cellranger/psi/R_process.ipynb
以上是关于ggplot2 Manhattan Plots的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章