34统计基础- 分位数标准化(Quantile Normalization)

Posted 2023-02-28

参考技术A

假设我们有一些来自微阵列实验的数据

如果你不熟悉微阵列，这里有解释:

因此，我们需要标准化数据来解释实验之间的技术差异，这与生物学无关。

这是我们的数据。在这张图中，每种颜色代表一个不同的基因。这些颜色与实际微阵列实验中扫描到的颜色不同。此时，那些颜色已经转换为强度值。每个样本都有不同的平均值，这表明我们需要对不同的整体光强进行补偿。 分位数标准化(Quantile Normalization) 纠正了这个技术。

分位数标准化(Quantile Normalization) 后，每个样本的值都相同，但是原始的基因顺序被保留了下来。他们称之为“Quantile Normalization”，因为标准化的数据集有分位数相同。