每日学习记录20230221_purr包 GSEA pandas

Posted 2023-04-11 Molesular Blog

20230221:purr包 GSEA pandas

1. purr的map_*函数的使用

   DF = List1 %>% names %>% map_dfr(function(x)   #把List1转化成DataFrame的格式, map_dfr是把结果都按行合并起来.
     return (data.frame(x ,
                List1[[x]]$\'all\'))
     )
   

2. 1. clusterProfile::GSEA调用的是DOSE::GSEA_internal
   2. DOSE::GSEA_internal 调用的是fgea包或者自己写的GSEA_DOSE函数

3. 总是忘记pandas的操作命令,感觉还是R操作数据框要方便一些

   data1.iloc[i,23]    第i行第23列数据
   X1=train_data.iloc[:,:22]   取前23列数据
   Y1=train_data.iloc[:,22]    取第23列数据
   

4. 学习时长:
   

TestLink学习——每日例会记录

2017.11.16例会内容

1、操作视频制作小组制作出了TestLink完整操作流程的图文文档，并在群里分享

2、各小组下载操作文档，在个人电脑上进行操作

3、撰写工具使用手册小组通过操作流程，记录下工具的使用说明，并通过具体例子来进一步说明TestLink软件的作用，完成工具使用手册的撰写

4、各小组成员在课后进行第二次例会，并在例会中，一同协助视频拍摄小组进行录屏拍摄的协作工作

5、最后完成工具实用手册和软件操作视频

6、博客记录小组完成最后的例会内容记录，并生成word文档，最终整合所有作业资料形成zip文件，并在SPOC平台上提交