易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列

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大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。

近些年以来,DNA甲基化研究一直是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点,其研究方向涵盖疾病发生发展、疾病标志物研究、环境因素暴露与响应、发育和分化等多维度。

研究人员为DNA甲基化课题申请作准备以及为降低DNA甲基化实验风险,通常会进行DNA甲基化研究的前期探索性实验,主要包括:

  • 检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达
  • 检测整体DNA甲基化水平变化
  • 其他前期实验

 

一、检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达

方法包括:

  • RT-qPCR检测mRNA表达
  • Western blot检测蛋白质翻译

e.g. 高脂饮食组和肥胖人群中均观察到DNMT的RNA和蛋白质表达上调

 

二、检测整体DNA甲基化水平变化

方法包括:

  • 5mC甲基化免疫荧光染色(定性)
  • DNA斑点杂交(定性)
  • 比色法(定量)
  • 质谱法(定量)

斑点杂交(Dot blot)

免疫荧光显微观察

比色法/质谱法

 

三、其他前期实验

在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下,也可以开展其他预实验。包括:

  • 关键表型指标测定
  • 转录组(成本低廉)

 

以上就是关于DNA甲基化研究的前期探索性实验及研究思路分享,易基因科技提供全面的DNA甲基化研究整体解决方案,技术详情了解请致电易基因。

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