MestReNova操作方法
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了MestReNova操作方法相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
MestReNove图谱分析
一、MestReNove基础设置以及便捷操作
view(视图)中
勾选Pages显示页面。
勾选Data Browser显示文件库,可移至右侧,导入文件,方便查看。
点击Shortcuts可查看快捷键。
勾选Spectrum Toolbar,右侧显示基本操作。
鼠标放在图谱空白区域滑动滚轮,图谱的纵坐标放大或缩小。
二、NMR图谱操作
2.1 图谱预处理
在processing(处理)中进行基线校正和相位校正。
(1)图谱放大后基线不平时可以进行基线校正。
Auto Baseline Correction——自动基线校正
基础设置:点击Auto Baseline Correction处下拉菜单中的Baseline Correction…(基线校正…)
方法推荐Bernstein Polynomial Fit 拟合方法(伯恩斯坦多项式拟合,第三个)。
点击图标或者全自动(Full Auto )将自动按照设置的方法进行校正。
(2)若图形相位不好,左右扭曲,可以进行相位校正。
Auto Phase Correction——自动相位校正
基础设置:点击Auto Phase Correction处下拉菜单中的Options(选项)。
针对一维氢谱,建议勾选G lobal(全局),Regions(范围),取消勾选Selective(选择性的,碳谱谱图可勾选 )。
Manual Correction——手动相位校正
针对自动相位校正不理想的情况下,可以进行手动相位校正。
点击手动校正——点击蓝色区域,会在最高最主要的一个信号上面出现一条浅蓝色的竖线,作为一个支点——将鼠标放在蓝色区域,按着鼠标的左键不动,上下移动鼠标,使蓝色竖线左右相位对称,对于其他距离蓝色竖线较远的地方,按着鼠标的右键不动,上下移动鼠标进行调整。调整结果仍不好时,可以移动蓝色竖线以其他信号作为支点进行调整。
2.2 图谱分析
在Analysis(分析)中进行定标,标识和积分。
(1)步骤一:Reference(参考)——定标
对于一张氢谱,通常情况下是需要进行定标的。一般使用TMS或者其他溶剂进行定标。
查看谱图的溶剂型号:在View中勾选Parameters,Parameters窗口中的Solvent项目显示溶剂型号。
查看溶剂的标准化学位移:若化学位移0附近有明显的信号,可以使用TMS(化学位移等于0)进行定标。若其他溶剂的标准化学位移未知,可点击修正窗口中的Solvents(溶剂)查看对应的化学位移。
具体操作:
1、放大需要定标的信号
2、点击Reference(参考)图标
3、将鼠标移动到对应信号上面(自动锁定顶点),点击左键,显示修正窗口
4、将New Shift修改为标准化学位移。
若溶剂峰的标准化学位移未知,可点击修正窗口中的Solvents(溶剂),找到对应的溶剂,单击,点击OK进行定标。
(2)步骤二:Peaks(峰)——标记化学位移
基础设置:点击Options(选项)图标,Method(方法)建议选择GSD(在标记化学位移时,软件还会对整张谱图进行全谱去卷积分析,信号中会出现蓝色线条,就是全谱去卷积拟合的结果,标记的化学位移值是以拟合的信号为准)。若不需要拟合出来的线,取消勾选Peak Curves。
勾选Auto Classify(自动分类),系统会自动区分化合物的信号和杂质的信号,将杂质的信号标红,同时在积分时剔除出去。
在具体标记化学位移时,有以下几种操作:
1、Auto Peak Picking——自动标记化学位移
点击Auto Peak Picking,系统会自动标记整张谱图的化学位移,其中红色是溶剂峰标识,但标记的数量太多,有很多没用的峰,不适用。
2、Manual Threshold——手动设置阈值(建议使用)
使用鼠标向上滚动,能更加容易清晰观察到有哪些是杂质比较低的信号,有哪些是需要的溶剂的信号。
点击Manual Threshold,把鼠标放在左侧,按着鼠标左键向右下角拖动,框选所有需要标记的信号(粉色区域),松开鼠标,软件会把处在粉色区域及以上的信号标记上化学位移,下方白色区域的小幅信号不标记。
3、Peak by Peak——逐个标峰
经过手动设置阈值标记后,若仍有部分信号未标记上,可以点击Pick by Pick(逐个标峰),一个个进行手动标记。
删除操作:
点击Delete All(全部删除),删除所以标记的化学位移。
点击Delete Manually(手动删除),手动删除不需要的化学位移。
其他操作:
点击NMR Peaks Table,显示一个表格,其中包含了所以标记的化学位移,并且对其进行归类,显示是杂质还是溶剂峰。
取消勾选Peak Curves,不显示GSD拟合的信号(蓝色线条)。
取消勾选Peak Labels,不显示标记的化学位移值。
(3)步骤三:Multiplets(多重峰分析)或Integration——积分
基础设置:点击Options,Calculation Method(积分计算方法)建议选择Peaks。
Sum积分方法计算信号线下的总面积(与GSD拟合结果无关),移动积分范围,积分值会改变。
Peaks积分方法将拟合出来的单峰面积相加(与GSD拟合结果有关),可以将信号进行拆分,移动积分范围,积分值不变。
1、Auto Multiplet Analysis——自动多重峰分析(建议使用)
多重峰分析不仅仅可以进行积分,自动做归一化,还可以判定峰的类型,标记最高峰的化学位移,并自动计算峰的耦合常数。
点击Auto Multiplet Analysis,自动对每一个信号进行多重峰分析(排除水和溶剂峰信号)。
归一化:将鼠标移到可判断出氢原子个数的信号处,双击该信号的多重峰分析结果(矩形框,积分值,积分线),弹出多重峰分析管理窗口,将积分改为已知的氢原子个数。
若需要对分析结果进行人为修改,可以双击信号的多重峰分析结果(矩形框,积分值,积分线)可对其进行修改。弹出的多重峰分析管理器会显示峰的所有信息,对于多重峰,存在耦合常数,点击Simulate Multiplets,软件可以根据得到的数据画出一个信号,与实际信号进行比较,用以检查。
点击Manually,对图谱进行手动积分。
点击NMR Multiplets Table,显示多重峰分析结果,可导出。
取消勾选Multiplet Labels,不显示多重峰分析得到的矩形框。
取消勾选Multiplets,不显示积分值。
取消勾选Multiplet Curves,不显示积分线。
2、Auto Integration——自动积分
仅能进行简单的积分,操作与标记化学位移类似。
三、图谱美化
右键点击属性(Properties)选项,弹出属性窗口,
(1)Genera(一般)
背景:颜色——黑色
透明度——0%
取消勾选Title,不显示标题
Title中可设置字体,格式,位置,对齐方式和偏移
(2)Grid(网格)
取消勾选Show Horizontal,Show Vertical,不显示横纵表格。
勾选Show Frame,显示边框
取消勾线Show Baseline,不显示基线
勾选Show Over,可以设置显示线条的颜色和宽度。
(3)1D(一维谱图显示)
调节谱线样式,颜色和线宽(电脑显示建议2.5,打印建议黑色1.0)
(4)Scales(比率)
可以设置横纵坐标的颜色,线宽,字体和页边留白。
一维谱图一般显示横坐标,不显示纵坐标。
横纵坐标可以设置标签,单位,最大小数位,间隔和位置。
(5)Peaks(标峰)
可以设置线的宽度颜色(取消勾选Use Curve Color),字体的样式,数字单位小数以及标记的位置(Peak Groups(峰(分组)))
在Visibility中Visible的下拉菜单中勾选Compound和Solvent(仅显示化合物和溶剂的化学位移)
(6)Integrals(积分)
(7)Multiplets(多重峰分析)
可以设置矩形框字体样式,背景,线宽,标签,小数点位数,积分地方距离横坐标距离,(勾选J’s Tree(偶合树)会显示明显裂分信号的偶合方式)。
Integrals
设置下方积分值处的颜色线宽,字体,小数位数,显示位置,显示方式,Range中的Margin处可设置距离底边的留白。
设置上分积分线的位置,最大高度。
点击左下角Set as Default,设置成默认。
四、调取相关信息
View中:
Tables中可以调取多重峰分析结果
勾选Parameters,显示谱图相关的原始信息(参数),可以在Customize自定义显示的信息
Molecule处可以专门画结构,或用Chemdraw画图。
五、其他操作
通过局部放大可以构建局部的另一副谱图
将整个页面作为一个模版可以点击View视图中的Layout Templates下的创建输出模版文档,同时可在此图标下粘贴模版。
第一次使用设置好基础选项后,对图谱分析基本流程:自动基线校正——自动相位校正——查找溶剂型及其化学位移——定标——用手动设置阈值和逐个标峰进行标定——自动多重峰分析——图形美化——导出。
以上是关于MestReNova操作方法的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章