如何更新r studio上r的版本

Posted 2023-04-09

RStudio Server 是 RStudio 公司打造的一款基于 Web 的开源编辑器，如果你熟悉 RStudio的桌面版本，那么使用RStudio Server对你来说基本上没什么难度。
在
实际的工程中，我们的服务器大多是基于Linux的，比如常见的 ubuntu、centos
等。这些操作系统有时并不提供图形化界面，这时候RStudio的服务器版本就派上用场了。启动RStudio
Server后，进入在浏览器中进入某一个页面后就可以像桌面版一样使用RStudio编辑器。当R的代码在服务器上出现bug了，线上的hotfix是
在所难免的，这时候必然会用到 RStudio Server 应个急。
这一次，我们将继续利用Docker神器，快速初始化RStudio Server环境的配置，并结合Git实现代码的版本控制。
准备
一个 Ubuntu 服务器
第一步：安装 RStudio Server
首先，我们通过docker 安装一个标准的RStudio Server
docker pull quantumobject/docker-rstudio
docker run -d -p 8787:8787 quantumobject/docker-rstudio

这样在你的电脑的8787端口就可以访问到rstudio的登陆界面了。
第二步：初始化 RStudio 账号
接着，我们需要初始化一个rstudio的账号
docker exec -it container-id /bin/bash
adduser harryzhu # 设置新用户名
passwd harryzhu # 设置该用户的密码
mkdir /home/harryzhu # 初始化工作空间
chmod -R harryzhu /home/harryzhu # 给工作空间赋权

第三步：安装 git
然后，我们进入rstudio的服务器，我们打算引入git版本控制
sudo apt-get install git-core

第四步：解决 ssh 的认证问题
使用 git 的过程可能遇到SSL certificate problem。对于ssh的问题，我们可以选择建立一个ssh认证的key，也可以在git中设置为忽略。
生成一个key：
$ssh-keygen -t rsa
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa):
Created directory '/root/.ssh'.

连续按下回车，跳过密码设置
显示秘钥信息：
sudo cat /root/.ssh/id_rsa.pub

如果没有ssh认证的需求，也可以选择忽略:
git config --global http.sslVerify false

第五步：在 RStudio Server 中配置Git
在最上方的菜单栏中可以选择Project Options。

接着填写配置。

第六步：克隆 Git 项目到本地
Git 功能已经集成在 RStudio-Server 中了，在新建项目时可以选择新建一个Version Control 的 Git 项目。 参考技术A Rstudio不会识别你想要链接的R版本，但是如果卸载旧的R版本的话，你以前的packages就不能用了。还要一个一个install

由于 3.4.4 包不兼容，将 R 更新到 4.0 或更高版本？格维兹

【中文标题】由于 3.4.4 包不兼容，将 R 更新到 4.0 或更高版本？格维兹

【英文标题】：Update R into 4.0 version or more due to 3.4.4 package incompatibility? Gviz

【发布时间】：2021-08-19 21:24:39

【问题描述】：

我目前在我的 MacOS Mojave 版本 10.14 上的 R Studio 上有 R 版本 3.4.4，但我正在尝试下载 R 版本 > 4。我需要这个，因为包 Gviz 仅适用于 4+ R 版本。任何有关如何下载 R 版本 > 4 的建议将不胜感激。

我已经使用了以下方法，但它们没有奏效：

方法一

RStudio.Version() 
install.packages("installr") 
library(installr) 
updateR()

方法二

在 RStudio 中，转到帮助 > 检查更新以安装较新版本的 RStudio（如果可用，可选）。 要更新包，请转到工具 > 检查包更新。如果有可用更新，请选择全部（或仅选择 tidyverse），然后单击安装更新。

通过这两种方法，我最终得到了 R 版本 3.4.4，但我需要 R 版本 >4

【问题讨论】：

你有什么理由不能只download R？

我使用的是 MacOS Mojave 10.14 版

我下载了 R 和最新版本，但出于某种原因，它只给了我 R 版本 3.4.4。

按照@r2evans 的建议，首先安装最新版本的 R，然后转到工具 -> 全局选项，然后将 R 版本切换到您安装的版本 (4.1.0)。

如果 RStudio 没有提供更新的版本，这意味着 (a) R-4 安装未成功完成，或者 (b) 它在系统 PATH 中不可见。意识到除非重新启动 RStudio，否则无法看到对 env-vars 的更改，因此重新启动 RStudio 可能会使其看到差异。如果不是，那么您需要将其作为一个不同的问题来处理 (cloud.r-project.org/bin/windows/base/…)。

【参考方案1】：

这些步骤通常是解决安装/更新 R (macOS) 问题的最快方法：

卸载 R. 卸载 RStudio。 重新启动计算机。 从https://cloud.r-project.org/下载并安装R（第一个链接： https://cloud.r-project.org/bin/macosx/base/R-4.1.0.pkg)。 从以下位置下载并安装 RStudio https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download（链接： https://download1.rstudio.org/desktop/macos/RStudio-1.4.1717.dmg)。 从您的 Applications 文件夹中打开 R 并检查版本是否正确。 从应用程序文件夹中打开 RStudio 并检查版本匹配。 从应用商店下载 Xcode 应用。 通过键入xcode-select --install 安装命令行工具 进入终端，或通过 Xcode 应用程序安装，或使用您的 Apple ID 下载并安装命令行工具 https://developer.apple.com/downloads/。 重新安装所有 R 包。 如果您无法从源代码构建包，请按照以下步骤操作 步骤：https://***.com/a/65334247/12957340。

如果您已完成这些步骤但仍然遇到困难，那么是时候寻求帮助了。