Python 之 h5py 读取 matlab 中 .mat 文件 cell 方法浅析
Posted 稚枭天卓
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Python 之 h5py 读取 matlab 中 .mat 文件 cell 方法浅析相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
采用 Python 读取 matlab 中 .mat文件的方法有很多,中外文的论坛上都不少,相关博文
可见:Python 从 mat 文件的读写和存储 到 h5py 文件包。
详址:http://blog.csdn.net/u013630349/article/details/47090299
但是,在读取matlab文件的时候,往往不是一层 .mat 就足以解决问题的,.mat 文件中可能是存放的 cell(100*200) 数据, cell(100*200)数据中又分为多个 cell 。那么,如何处理这样的数据结构,实现Python对matlab这一类型数据的读取呢,现对该问题,详解如下:
【问题一】
matlab之中有FEAT_Name.mat文件,该文件的形式如下
FEAT_Name.mat <1x10 cell> ——> each element is <600x5755 double>
先要实现对FEAT_Name元组的首个矩阵的读取操作,代码实现如下
myfile=h5py.File('F:\\\\wfpdm\\\\20150702_2105\\\\FEAT_Name.mat','r')
data = [myfile[element[0]][:] for element in myfile['FEAT_Name']]
print data[1].shape
Out: (5755,600)
解析
1)for element in myfile['FEAT_Name'] 实现了对 myfile['FEAT_Name'] 的 cell 的遍历;
2)myfile[element[0]]恰好可以理解为myfile[element],即当前文件的当前cell;
3)[myfile[element[0]][:] for element in myfile['FEAT_Name']],实现了将数据以list结构存入data之中;
4)数据转置了600x5755变成了5755x600,需要实现再转置操作;
【问题二】
matlab之中有f.mat文件,该文件的形式如下
——> rank <1x454 cell> ——> each element is <53x50 double>
f.mat
——> compare <1x454 cell> ——> each element is <53x50 double>
先要实现对rank元组的首个矩阵的操作,代码实现如下
f = h5py.File("f.mat")
data = [f[element[0]][:] for element in f['rank']]
result:
In : data[0].shape
Out: (50L, 53L)
In : data[1].shape
Out: (50L, 53L)
解析
这里只是多一步,将matlab数据的 cell.name 写入即可。至此,Python读取matlab的数据方法介绍完毕。
【复盘】
确实存在转置,只是一般的array结构的 .mat 文件不存在,但是针对cell结构的 .mat 文件 存在。需要进行再转置操作,还原数据。
详见:Python 从 mat 文件的读写和存储 到 h5py 文件包。
详址:http://blog.csdn.net/u013630349/article/details/47090299
这是笔者第一次完完全全通过外文网站论坛实现问题突破,一直到现在,完成了小结这个知识点的时候还是很兴奋。继续码去了,KK~ !~
【参考】
http://stackoverflow.com/questions/27670149/read-matlab-v7-3-file-into-python-list-of-numpy-arrays-via-h5py
以上是关于Python 之 h5py 读取 matlab 中 .mat 文件 cell 方法浅析的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
用于 Python 的 HDF5:高级与低级接口。 h5py
在 Matlab 中转置 Python 创建的 HDF5 数据集