awk 拼接字符串的问题

Posted 2023-04-18

有谁知道awk中如何在拼接的字符串中包含双引号 ( " ) ？
这里有一个脚本：
1 #!/bin/sh
2
3 awk '
4 BEGIN
5 name = "longNBS.ID"
6 while(getline < name > 0) record[$1]++
7
8
9 close(name)
10 for(any in record)
11
12 command = "grep -P -m 1 "any" Sorbi1_GeneModels_AllModels_20080319.gff"
13 #print command
14 command | getline
15 lines[$0]++
16
17 for(pp in lines) print pp
18
19 ' $*

其中第12行是正则搜索，any部分是正则表达式，需要用双引号括起来才能给shell执行，但是直接加上双引号awk会报错....
请教大牛！！

参考技术A 具体报错信息是什么？这样才能帮你定位！
把#print command的注释去掉，看看打印的是什么！
awk字符串拼接就是直接连，字符串部分用“”，引用变量不需要“”，直接写！
你的错误不一定是这个地方引起的！ 参考技术B 你报错的原因应该是
grep 前的双引号和any前的双引号配对的原因
这种情况
通常是用单引号或 \ 转意来避免 参考技术C 加转义符试试：
command = "grep -P -m 1 \"any\" Sorbi1_GeneModels_AllModels_20080319.gff"本回答被提问者采纳

awk

命

令格式与特殊变量

awk ‘BEGIN {命令} {命令} END {命令}‘

说明:

• ""被当做拼接符使用
• 参数用","分割时,参数打印则以空格作为分割符输出
• NR获取当前读取文件当前行号
• NF获取当前读取文件当前行字段数
• $0获取当前读取文件当前行文本
• $n(其中n>0)获取当前读取文件当前行第n个字段内容

常用参数

• awk -v v2=$v1 ‘{print v2}‘:引用外部变量(v1在此命令之前定义)
• awk ‘/regex/‘ :符合正则表达式的行
• awk ‘!/regex/‘ :不符合正则表达式的行

自带字符串函数

• length(string):获取字符串长度
• index(string,pattern):获取pattern字符串在string中出现的位置
• split(string,array,delimiter):用delimiter将string分割并存入array数组
• substr(string,strat,end):获取string从strat到end位置字符子串
• sub(regex,replace,string):将string中第一个符合正则表达式regex的替换为replace
• gsub(regex,replace,string):将string中所有符合正则表达式regex的替换为replace