背景:
Blei的hlda的C语言实现需要使用C语言的科学计算包GSL,因此决定安装。由于在windows下安装极其繁琐,先在Linux上安装之。
系统环境:
gsl安装过程
/usr/local/lib
If you ever happen to want to link against installed libraries
in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and
specify the full pathname of the library, or use the `-LLIBDIR\'
flag during linking and do at least one of the following:
- add LIBDIR to the `LD_LIBRARY_PATH\' environment variable
during execution
- add LIBDIR to the `LD_RUN_PATH\' environment variable
during linking
- use the `-Wl,--rpath -Wl,LIBDIR\' linker flag
- have your system administrator add LIBDIR to `/etc/ld.so.conf\'
See any operating system documentation about shared libraries for
more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.
- #include <stdio.h>
- #include <gsl_rng.h>
- #include <gsl_randist.h>
- int main (int argc, char *argv[])
- {
- /* set up GSL RNG */
- gsl_rng *r = gsl_rng_alloc(gsl_rng_mt19937);
- /* end of GSL setup */
- int i,n;
- double gauss,gamma;
- n=atoi(argv[1]);
- for (i=0;i<n;i++)
- {
- gauss=gsl_ran_gaussian(r,2.0);
- gamma=gsl_ran_gamma(r,2.0,3.0);
- printf("%2.4f %2.4f\\n", gauss,gamma);
- }
- return(0);
- }
显示错误是:gsl_test.c:2: fatal error: gsl_rng.h: 没有那个文件或目录
(2)这个错误是说没有找到头文件,然后加上头文件的位置,gcc -I/usr/local/include/gsl gsl_test.c
显示错误是:gsl_test.c:(.text+0x12): undefined reference to `gsl_rng_mt19937\' ...
(3)这个错误是说没有找到gsl_rng_mt19937的定义,查看了http://www.daniweb.com/software-development/cpp/threads/289812/cant-link-gsl-properly,这里说需要加上-lgsl,即链接到gsl,找到 libgsl.so.
使用命令:gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl gsl_test.c
(4)显示错误是://usr/local/lib/libgsl.so: undefined reference to `cblas_ctrmv\'
查看了http://sourceware.org/ml/gsl-discuss/2003-q2/msg00123.html,是说错误是由于没有链接libgslcblas.so引起的,再加上-lgslcblas可以解决问题。
使用命令:gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl -lgslcblas gsl_test.c。
或者命令:gcc -I/usr/local/include/gsl -L/usr/local/lib -lgsl -lgslcblas gsl_test.c
(5)实测需要以下命令: gcc -I/usr/local/include/gsl gsl_test.c -lgsl -lgslcblas
这个时候出现了产出物a.out。
(5)运行a.out
./a.out 出现错误“段错误”
(6)查看源文件,发现还需要输入参数
./a.out 10
结果是:
0.2678 6.9645
3.3488 1.6894
1.9950 2.1575
-4.7934 6.1648
-0.0782 4.0292
1.7871 11.6031
-2.5931 7.7629
0.3634 1.3344
-1.0965 11.1658
0.0142 3.5412
彻底搞定,done#
转自:http://blog.csdn.net/Waleking/article/details/8265008
由于论文数据处理的需要,需要使用libeemd
这个包,需要安装gsl
科学库,windows
下没有办法,只能转战ubuntu
进行科学计算。
GSL(GNU Scientific Library)
作为三大科学计算库之一,除了涵盖基本的线性代数,微分方程,积分,随机数,组合数,方程求根,多项式求根,排序等,还有模拟退火,快速傅里叶变换,小波,插值,基本样条,最小二乘拟合,特殊函数等
当然最希望通过命令来安装GSL科学库。
方法一:
GSL源码包提供了以下二进制包:
- gsl-bin:GNU Scientific Library (GSL) -- binary package
- libgsl0-dbg: GNU Scientific Library (GSL) -- debug symbols package
- libgsl0-dev: GNU Scientific Library (GSL) -- development package
- libgsl0ldbl: GNU Scientific Library (GSL) -- library package
终端键入以下命令即可安装:
sudo apt-get install libgsl0ldbl
说明:根据不同的需要选择安装不同的版本,使用 gsl-bin
将会安装所有的内容(gsl - bin
依赖 libgsl0ldbl
)
方法二:
ubuntu自己编译源码(使用gsl1.6,windows上太麻烦折腾),解压后进入目录,执行:
./configure
make
make install
这个过程需要几分钟。这里还有一点需要注意的是,执行 make install
时,会自动将动态库和头文件分别拷贝到/usr/local/lib
和 /usr/local/include
下面,但如果这两个目录没有写权限,就无法创建此二目录,导致安装失败,此时改用 sudo make install
或者手动去赋予权限,便能解决此问题。
说明:折腾一圈还是使用前者成功的。
sudo apt-get install libgsl0-dev
参考
- http://www.lancezhange.com/2014/10/24/gsl-in-practice/
- http://www.cnblogs.com/nju2014/p/5334928.html