《纳米孔:生物分自相互作用传感基础》读书笔记

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纳米孔DNA测序方法至少要满足4个条件:

1.用于测序的通道和薄膜必须足够牢固,要可以耐受用来消除聚核苷酸二级结构影响所需的温度和化学反应。

2.纳米孔通道的长度必须与0.4mm的碱基间距在一个数量级以上(为了使DNA的易位速度恒定)

3.每种核苷酸必须要产生一种特征性的瞬态阻塞电流

4.碱基易位的速率必须要低于离子电流测量系统的时间分辨率

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主要的DNA测序方法

1.KBBD 方案

2.横向电子传输

3.半导体纳米孔-电容器

4. 解旋所需DNA(荧光法)

5.杂交辅助纳米孔DNA测序

6.牛津纳米孔DNA测序

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影响DNA易位速度的因素:溶液的黏度、外加偏执电压、盐浓度、溶液温度

增加黏度、减小外加偏执电流、减小离子浓度和降低温度可以降低DNA的易位速率。但同时也会减弱离子电流信号。

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控制DNA易位速度的方法:光镊、磁镊、DNA晶体管

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DNA的捕获速率R= 2 pai CDr  C为DNA的浓度 D 为自由溶液中DNA的扩散系数;  r为孔的捕获半径。

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纳米孔中的DNA受三种力影响:电场力,作用域带负电荷的DNA链的磷酸盐骨架上;范德华力,与孔壁相互作用的静电力和非极性力;拉力。

以上是关于《纳米孔:生物分自相互作用传感基础》读书笔记的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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