油猴脚本批量快速下载ncbi上pubmed的论文

Posted 2022-05-19 webchang

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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了油猴脚本批量快速下载ncbi上pubmed的论文相关的知识，希望对你有一定的参考价值。

文章目录

1. 前言
2. 功能描述
3. 安装使用教程
4. 其它说明
5. 最后

1. 前言

通常情况下，下载pubmed上的论文时，需要一篇篇的去复制论文的doi号或者PMID号，到https://sci-hub.ee/上搜索下载。

上述的下载过程多少有些繁琐，能不能提升一下论文的下载效率呢？能不能批量下载？另外，有些论文在sci-hub上没有收录，复制doi号去查找时发现不能下载，浪费了时间，那么能不能在pubmed的这个页面就提前知道某篇论文是否可以下载？答案是可以的。

笔者编写了一个油猴脚本来实现上述功能。

2. 功能描述

该脚本的详细功能如下：

点击【下载所有】按钮，即可下载当前页面的所有论文
点击选中论文左侧的方框，然后点击【下载选中】按钮，即可下载选中的论文
如果谋篇论文被sci-hub收录，论文的标题右侧将显示一个下载图标，点击该图标，即可下载对应的单篇论文
论文描述中的doi号被改为了链接，点击之后会自动搜索该论文是否被sci-hub收录，如果收录则会跳转到对应的下载页面。

提示：
（1）对于pubmed每页显示的论文，脚本会首先判断这些论文哪些能下载（被sci-hub收录），哪些不能下载。所以说，即使点击了【下载所有】按钮，它也只会下载sci-hub上收录的论文。
（2）对于能下载的论文会在标题右侧显示一个图标。
（3）没有doi号的论文无法下载。
（4）此脚本的使用范围是ncbi上的pubmed

3. 安装使用教程

以谷歌浏览器为例

3.1 安装油猴插件

方法1：谷歌应用商店搜索Tampermonkey

方法2：进入https://www.tampermonkey.net/安装

3.2 安装脚本

点击安装脚本ncbi论文下载

3.3 进入pubmed论文页面

点击进入https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=aav+gene。

在安装完成之后，首次进入pubmed的论文页面，会出现下方页面，要点击【总是允许】

3.4 开启谷歌浏览器的并行下载

在批量下载论文时，可以提升下载速度

在浏览器地址栏输入这个地址：chrome://flags/#enable-parallel-downloading

然后设置parallel downloading为Enabled，重启谷歌浏览器就好了。

3.5 完成

大功告成，开始使用。

4. 其它说明

4.1 使用我的服务器

我编写了相应的代码来搜索某篇论文是否被sci-hub收录，此代码在我的服务器上运行，而这台服务器将在2022年11月份到期，之后脚本会无法使用。不过不用担心，到时候我会买一台新的服务器，重新部署代码。（为什么不续费服务器？因为续费太贵了。）

所以可以收藏这篇博客，到2022.11后，当发现脚本无法使用时，重新安装脚本ncbi论文下载脚本即可。届时我会将最新的脚本文件上传上去。

4.2 自己部署服务

如果不想使用我的服务器，想要自己部署服务，我也将代码放在了上方的链接中。可自行下载使用。可以选择开启本地服务，也可以部署到你自己的服务器。

4.2.1 开启本地服务

可以选择在本地自己的电脑上开启服务，使用步骤如下：

将代码下载到你的电脑上
下载安装node
进入代码所在的文件夹，鼠标放在上方的地址栏中，输入cmd，回车
在黑色窗口中，输入npm install，回车，等待安装，之后就可以将这个窗口关掉了。
双击start.bat文件

之后会打开一个新的黑色窗口，如下，说明启动成功。注意在使用脚本期间，这个窗口不能关闭！
进入油猴插件的管理面板，找到【ncbi论文下载】的脚本，点击进入

然后会进入代码编写页面，大概在70行的位置，修改url的值为：http://127.0.0.1:3000，然后CTRL + S保存。大功告成。
以上步骤只需要操作一遍。之后再次使用时，只需要进行【步骤5】，重启启动即可，启动成功后，窗口不能关闭。