Linux上C++与CUDA混合编程

Posted 白水baishui

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Linux上C++与CUDA混合编程相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

为了更好地说明如何在Linux实现C++与CUDA的混合编程,我接下来将以实现对一个矩阵的每一个元素的取模运算。

1. 头文件和文件形式

要在C++中编写CUDA代码,需要引入头文件:

#include "cuda_runtime.h"
#include "cublas_v2.h"
#include "device_launch_parameters.h"

然后将文件后缀由.cpp改为.cu

2. 搭建程序框架

一个CUDA程序的框架类似于普通C++程序,下面我们来展示其中一种简单的形式:

// mod_test.cu
#include "cuda_runtime.h"
#include "cublas_v2.h"
#include "device_launch_parameters.h"

// 自己实现的CUDA取模运算函数
__global__ void mod_kernel(args) {
	// ...  
}

// 进行矩阵元素取模运算
void mat_mod_cu(args){
	// ...

	 // 调用自己实现的CUDA取模运算函数
    mod_kernel <<< gridSize, blockSize >>> (args);

	// ...
}

int main(void){
	// 定义cuda消息处理器
	cublasHandle_t cuHandle;
    cublasStatus_t status = cublasCreate(&cuHandle);

	// ...
    
    // 进行矩阵元素取模运算
    mat_mod_cu(args);

	// ...
	
	// 销毁cuda消息处理器
    cublasDestroy(cuHandle);
	return 0;
}

在上面的框架中:

__global__ void mod_kernel(args)

是自己编写的要在GPU中执行的代码,__global__指明该函数是kernel函数,调用时用<<< >>>语法配置并行化参数;返回值是void的;mod_kernel是CUDA函数名;args是参数。

接下来我们基于此框架实现CUDA取模运算。

2.1. main() 函数

为了获得良好的封装性,main()函数需要向mat_mod()传入需要取模的矩阵、其行列数、取模值、cuda控制符,那么可以在main()函数中编写如下代码:

int main(void){
	// 1.定义cuda消息处理器
	cublasHandle_t cuHandle;
    cublasStatus_t status = cublasCreate(&cuHandle);

	// 2.定义要取模的矩阵
	long q = 3; // 取模数
	long rowSize = 4; // 矩阵行数
    long colSize = 6; // 矩阵列数
    long** M1 = uniformMat(rowSize, colSize, 5, 9); // 生成一个rowSize*colSize的随机矩阵,元素值在[5, 9]内随机选取

    // 3.进行矩阵元素取模运算
    long** M2 = mat_mod_cu(M1, rowSize, colSize, q, cuHandle);

	// 4.输出原矩阵M1和取模后的矩阵M2
	cout << "M1: " << endl;
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            cout << M1[i][j] << " ";
        }
        cout << endl;
    }
    cout << "M2: " << endl;
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            cout << M2[i][j] << " ";
        }
        cout << endl;
    }
    
	// 5.销毁cuda消息处理器
    cublasDestroy(cuHandle);
    
	return 0;
}

uniformMat()函数是用于生成随机矩阵的函数,它的实现如下:

long** uniformMat(long rowSize, long colSize, long minValue, long maxValue) {
    long** mat = new long* [rowSize];
    for (long i = 0; i < rowSize; i++)
        mat[i] = new long[colSize];

    srand((unsigned)time(NULL));
    for (long i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (long j = 0; j < colSize; j++) {
            mat[i][j] = (long)(rand() % (maxValue - minValue + 1)) + minValue;
        }
    }

    return mat;
}

2.2. mat_mod_cu() 函数

mat_mod_cu()函数主要复制将矩阵存入GPU内存中,然后调用cuda函数进行运算,再将运算结果从GPU中调出。它的定义如下:

long** mat_mod_cu(long** M1, long rowSize, long colSize, long q, cublasHandle_t cuHandle) {
    // 1.定义结果矩阵,用于返回
    long** M2 = new long* [rowSize];
    for (long i = 0; i < rowSize; i++)
        M2[i] = new long[colSize];

    // 2.分配CPU资源
    double* h_M1 = (double*)malloc(rowSize * colSize * sizeof(double));
    double* h_M2 = (double*)malloc(rowSize * colSize * sizeof(double));
	// 初始化h_M1
    for (long i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (long j = 0; j < colSize; j++) {
            h_M1[i * colSize + j] = (double)M1[i][j];
        }
    }

    // 3.分配GPU资源
    double* d_M1;
    double* d_M2;
    cudaMalloc((void**)&d_M1, rowSize * colSize * sizeof(double));
    cudaMalloc((void**)&d_M2, rowSize * colSize * sizeof(double));
    // 将CPU数据拷贝到GPU上
    cudaMemcpy(d_M1, h_M1, rowSize * colSize * sizeof(double), cudaMemcpyHostToDevice);

    // 4.定义kernel的执行配置
    int blockSize;
    int minGridSize;
    int gridSize; 
	// 获取GPU的信息,并配置最优参数
    cudaOccupancyMaxPotentialBlockSize(&minGridSize, &blockSize, mod_kernel, 0, rowSize * colSize);
    gridSize = (rowSize * colSize + blockSize - 1) / blockSize; 

    // 5.执行核函数
    // 取模
    mod_kernel <<< gridSize, blockSize >>> (d_M1, d_M2, q, rowSize*colSize);

    // 6.将GPU数据拷贝到CPU上
    cudaMemcpy(h_M2, d_M2, rowSize * colSize * sizeof(double), cudaMemcpyDeviceToHost);

    // 7.赋值给结果矩阵
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            M2[i][j] = static_cast<long>(h_M2[i * colSize + j]);
        }
    }

    // 8.清理掉使用过的内存
    free(h_M1); free(h_M2);
    cudaFree(d_M1); cudaFree(d_M2);

    return M2;
}

CUDA对矩阵的运算,需要先把矩阵展平为一维向量,因此也就有了第二步,分配CPU资源。然后在把这个一维向量传入GPU中,也就是第三步。之后再对位于GPU中的矩阵进行运算,在运算之前需要指定一些用于并行计算的参数,在第四步中已经设置了自动获取,因此不再需要手动配置。这样就可以执行核函数进行取模运算了。运算完毕之后从GPU内取出数据到CPU,再展开为二维矩阵,返回,就行了。

2.3. mod_kernel() 函数

mod_kernel() 是最终在GPU中执行计算的函数,它的定义如下:

__global__ void mod_kernel(double* d_M1, double* d_M2, long q, int n) {
    // index
    int idx = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;

    long x;
    if (idx < n){    
        x = d_M1[idx];
        d_M2[idx] = x % q;
    }
}

由代码可见,核函数并不一定需要for循环来遍历执行整个矩阵,这是因为在调用该核函数时指定了gridSize和blockSize,使得矩阵在GPU内是以并行的形式执行的。只需要明确遍历完矩阵内每一个元素即可。

如果想在核函数中输出信息,那么可以用printf,而不是cout。

3. 完整代码及运算结果

完整代码:

/*
    mod_test.cu
*/

#include "cuda_runtime.h"
#include "cublas_v2.h"
#include "device_launch_parameters.h"
#include <iostream>
#include <stdio.h>

using namespace std;

__global__ void mod_kernel(double* d_M1, double* d_M2, long q, int n) {
    // index
    int idx = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;

    long x;
    if (idx < n){    
        x = d_M1[idx];
        // printf("x: %d\\n", x)
        d_M2[idx] = x % q;
    }
}

long** mat_mod_cu(long** M1, long rowSize, long colSize, long q, cublasHandle_t cuHandle) {
    // 1.定义结果矩阵,用于返回
    long** M2 = new long* [rowSize];
    for (long i = 0; i < rowSize; i++)
        M2[i] = new long[colSize];

    // 2.分配CPU资源
    double* h_M1 = (double*)malloc(rowSize * colSize * sizeof(double));
    double* h_M2 = (double*)malloc(rowSize * colSize * sizeof(double));
	// 初始化h_M1
    for (long i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (long j = 0; j < colSize; j++) {
            h_M1[i * colSize + j] = (double)M1[i][j];
        }
    }

    // 3.分配GPU资源
    double* d_M1;
    double* d_M2;
    cudaMalloc((void**)&d_M1, rowSize * colSize * sizeof(double));
    cudaMalloc((void**)&d_M2, rowSize * colSize * sizeof(double));
    // 将CPU数据拷贝到GPU上
    cudaMemcpy(d_M1, h_M1, rowSize * colSize * sizeof(double), cudaMemcpyHostToDevice);

    // 4.定义kernel的执行配置
    int blockSize;
    int minGridSize;
    int gridSize; 
	// 获取GPU的信息,并配置最优参数
    cudaOccupancyMaxPotentialBlockSize(&minGridSize, &blockSize, mod_kernel, 0, rowSize * colSize);
    gridSize = (rowSize * colSize + blockSize - 1) / blockSize; 

    // 5.执行核函数
    // 取模
    mod_kernel <<< gridSize, blockSize >>> (d_M1, d_M2, q, rowSize*colSize);

    // 6.将GPU数据拷贝到CPU上
    cudaMemcpy(h_M2, d_M2, rowSize * colSize * sizeof(double), cudaMemcpyDeviceToHost);

    // 7.赋值给结果矩阵
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            M2[i][j] = static_cast<long>(h_M2[i * colSize + j]);
        }
    }

    // 8.清理掉使用过的内存
    free(h_M1); free(h_M2);
    cudaFree(d_M1); cudaFree(d_M2);

    return M2;
}

long** uniformMat(long rowSize, long colSize, long minValue, long maxValue) {
    long** mat = new long* [rowSize];
    for (long i = 0; i < rowSize; i++)
        mat[i] = new long[colSize];

    srand((unsigned)time(NULL));
    for (long i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (long j = 0; j < colSize; j++) {
            mat[i][j] = (long)(rand() % (maxValue - minValue + 1)) + minValue;
        }
    }

    return mat;
}

int main(void){
	// 1.定义cuda消息处理器
	cublasHandle_t cuHandle;
    cublasStatus_t status = cublasCreate(&cuHandle);

	// 2.定义要取模的矩阵
    long q = 3; // 取模数
	long rowSize = 4; // 矩阵行数
    long colSize = 6; // 矩阵列数
    long** M1 = uniformMat(rowSize, colSize, 5, 9); // 生成一个rowSize*colSize的随机矩阵,元素值在[5, 9]内随机选取

    // 3.进行矩阵元素取模运算
    long** M2 = mat_mod_cu(M1, rowSize, colSize, q, cuHandle);

	// 4.输出原矩阵M1和取模后的矩阵M2
	cout << "M1: " << endl;
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            cout << M1[i][j] << " ";
        }
        cout << endl;
    }
    cout << "M2: " << endl;
    for (int i = 0; i < rowSize; i++) {
        for (int j = 0; j < colSize; j++) {
            cout << M2[i][j] << " ";
        }
        cout << endl;
    }
    
	// 5.销毁cuda消息处理器
    cublasDestroy(cuHandle);
    
	return 0;
}

在命令行中执行:

nvcc -lcublas mod_test.cu -o mt
./mt

运算结果:

M1: 
9 6 5 9 9 8 
9 8 6 5 7 9 
5 6 6 6 8 7 
5 6 5 9 9 5 
M2: 
0 0 2 0 0 2 
0 2 0 2 1 0 
2 0 0 0 2 1 
2 0 2 0 0 2

成功!

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