Paper简读 - ProGen2: Exploring the Boundaries of Protein Language Models

Posted 2023-03-03 SpikeKing

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ProGen2: Exploring the Boundaries of Protein Language Models

• ProGen2：探索蛋白质语言模型的边界

Cumulative density：累积密度

Ligand：在生物化学和药理学中，配体（英语：ligand）是指一种能与受体结合以产生某种生理效果的物质。在蛋白质—配体复合物中，配体通常是与靶蛋白特定结合位点相连的信号触发分子。而在DNA—配体复合物中，与DNA双链相连的配体在一般情况下可以是任何的小分子或离子甚至是蛋白质。

Foldseek：查找最相似的结构

AlphaFold2：生成蛋白结构

Abstract(摘要)

Attention-based models trained on protein sequences have demonstrated incredible success at classification and generation tasks relevant for artificial intelligence driven protein design.

• 在蛋白质序列上，训练的基于注意力的模型，在与人工智能驱动的蛋