R使用tsne进行高维数据可视化实战：二维可视化三维可视化

Posted 2021-08-27 Data+Science+Insight

R使用tsne进行高维数据可视化实战：二维可视化、三维可视化

t-SNE是一种非常强大的技术，可以用于多维数据中的可视化分析（寻找模式）。它对复杂多维数据的可视化能力是显而易见的，它以无监督的方式对数据进行聚类的能力也是显而易见的。

由于t-SNE能够提供保持原始结构的高维数据的2D或3D可视化表示，我们可以在数据探索中（Exploratory Data Analysis）使用它。我们可以使用它来检查数据中是否存在集群，并作为一种可视化来检查数据集中是否存在某种“顺序”或某种“模式”。

二维可视化

# tsne可视化迭代输出图形及误差；

install.packages(\'tsne\')
library(tsne)
traindata <- read.table("optdigits.tra", sep=",")
trn <- data.matrix(traindata)

require(tsne)

cols <- rainbow(10)

# this is the epoch callback function used by tsne. 
# x is an NxK table where N is the number of data rows passed to tsne, and K is the dimension of the map. 
# Here, K is 2, since we use tsne to map the rows to a 2D representation (map).
ecb = function(x, y){ plot(x, t&#