如何让rgdal打开地理数据库(.gdb)文件?

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了如何让rgdal打开地理数据库(.gdb)文件?相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

我正在尝试使用rgdal :: readOGR读取.gdb文件。几天前我通过删除路径末尾的尾部“/”和文件名末尾的.gdb来让它工作。然后,噗!今天我的代码不起作用。据我所知,一切都没有改变!

我的代码失败后,我尝试更新所有内容,所以我现在正在运行:Mac OS10.14.4,RStudio v1.2.1335,R v3.6.0和rgdal v1.4-3。我已经检查过rgdal有OpenFileGDB驱动程序。我还尝试将.gdb扩展名添加到文件名中,并更改.lyr文件名以匹配.gdb文件名,但没有任何作用。

这是我正在使用的代码......

gdb <- path.expand("Data/GIS/CA_LandUse2014/ds2677")
luca <- readOGR(gdb, "ds2677")

这是错误消息:

Error in ogrInfo(dsn = dsn, layer = layer, encoding = encoding, use_iconv = use_iconv,  : 
  Cannot open data source

这些是ds2677文件夹中的文件:

> list.files(path.expand("Data/GIS/CA_LandUse2014/ds2677"))
[1] "ds2677_LandUse2014.lyr" "ds2677.gdb"        

这些是ds2677.gdb中的文件。

> list.files(path.expand("Data/GIS/CA_LandUse2014/ds2677/ds2677.gdb"))
 [1] "a00000001.freelist"                          "a00000001.gdbindexes"                       
 [3] "a00000001.gdbtable"                          "a00000001.gdbtablx"                         
 [5] "a00000001.TablesByName.atx"                  "a00000002.gdbtable"                         
 [7] "a00000002.gdbtablx"                          "a00000003.gdbindexes"                       
 [9] "a00000003.gdbtable"                          "a00000003.gdbtablx"                         
[11] "a00000004.CatItemsByPhysicalName.atx"        "a00000004.CatItemsByType.atx"               
[13] "a00000004.FDO_UUID.atx"                      "a00000004.freelist"                         
[15] "a00000004.gdbindexes"                        "a00000004.gdbtable"                         
[17] "a00000004.gdbtablx"                          "a00000004.spx"                              
[19] "a00000005.CatItemTypesByName.atx"            "a00000005.CatItemTypesByParentTypeID.atx"   
[21] "a00000005.CatItemTypesByUUID.atx"            "a00000005.gdbindexes"                       
[23] "a00000005.gdbtable"                          "a00000005.gdbtablx"                         
[25] "a00000006.CatRelsByDestinationID.atx"        "a00000006.CatRelsByOriginID.atx"            
[27] "a00000006.CatRelsByType.atx"                 "a00000006.FDO_UUID.atx"                     
[29] "a00000006.freelist"                          "a00000006.gdbindexes"                       
[31] "a00000006.gdbtable"                          "a00000006.gdbtablx"                         
[33] "a00000007.CatRelTypesByBackwardLabel.atx"    "a00000007.CatRelTypesByDestItemTypeID.atx"  
[35] "a00000007.CatRelTypesByForwardLabel.atx"     "a00000007.CatRelTypesByName.atx"            
[37] "a00000007.CatRelTypesByOriginItemTypeID.atx" "a00000007.CatRelTypesByUUID.atx"            
[39] "a00000007.gdbindexes"                        "a00000007.gdbtable"                         
[41] "a00000007.gdbtablx"                          "a0000000a.FDO_GlobalID.atx"                 
[43] "a0000000a.gdbindexes"                        "a0000000a.gdbtable"                         
[45] "a0000000a.gdbtablx"                          "a0000000a.spx"                              
[47] "gdb"                                         "timestamps"     

请帮忙!

答案

ogrListLayers(src)告诉你什么?我认为src需要成为包括ds2677.gdb在内的道路。

这对我有用 - RI_geodatabase_wetlands.gdb是包含所有a0000001.etc文件的文件夹:

> ogrListLayers("/data/gdb/RI_geodatabase_wetlands.gdb")
[1] "Rhode_Island"                  "RI_Wetlands"                  
[3] "RI_Wetlands_Project_Metadata"  "RI_Wetlands_Historic_Map_Info"
attr(,"driver")
[1] "OpenFileGDB"
attr(,"nlayers")
[1] 4

现在我有了图层名称,我可以一次读取一个图层:

> RI = readOGR("/data/gdb/RI_geodatabase_wetlands.gdb","Rhode_Island")
OGR data source with driver: OpenFileGDB 
Source: "/data/gdb/RI_geodatabase_wetlands.gdb", layer: "Rhode_Island"
with 1 features
It has 5 fields

看看你在这里尝试了什么:

gdb <- path.expand("Data/GIS/CA_LandUse2014/ds2677")
luca <- readOGR(gdb, "ds2677")

我怀疑你应该这样做:

gdb <- path.expand("Data/GIS/CA_LandUse2014/ds2677/ds2677.gdb")    
ogrListLayers(gdb)

然后选择你想要的图层名称并执行:

luca <- readOGR(gdb, "some_layer_name")
另一答案

我没有使用rgdal,但是与空间数据交互的另一个强大的替代方法是sf包。要从地理数据库加载,您可以使用st_read(dsn,layer),例如

library(sf)
luca <- st_read("data/mygeodatabase.gdb", layer = "layername")
另一答案

这就是我在R 3.60中使用rgdal 1.4-4驱动程序在Windows 10上没有ARC-GIS许可证的情况。请注意,我正在将* .gdbtable文件转换为shp文件,最终在Google地球专业版中使用。只有一个gdbtable文件没有'null geometry'或我感兴趣的字段。所以编号的文件对我来说并不感兴趣。但是ogrInfo证明了“a0000000b.gdbtable”很有意思。警告:我只是在发布我是如何破解它的。很多时候我发现R代码中的GIS代码非常特殊,以至于我不想理解库的功能,就像我应该的那样。我只是让它工作得很好,给我一个ESRI shp文件导入。

dir(pattern="*gdbtable")
[1] "a00000001.gdbtable" "a00000002.gdbtable" "a00000003.gdbtable" "a00000004.gdbtable" "a00000005.gdbtable" "a00000006.gdbtable" "a00000007.gdbtable" "a0000000b.gdbtable"


library(data.table)
library(rgdal) #rgdal_1.4-4

sessionInfo()  
nrow(ogrDrivers())
as.data.table(ogrDrivers())[grepl("ESRI",long_name),]
cat('
             name                 long_name write  copy isVector
1: ESRI Shapefile            ESRI Shapefile  TRUE FALSE     TRUE
2:    OpenFileGDB              ESRI FileGDB FALSE FALSE     TRUE
')

 setwd("C:/Users/username/Downloads/EAP_ENV_AmbientStations/EAP_ENV_AmbientStations.gdb")
ogrInfo("a0000000b.gdbtable")
cat('
Source: "C:UsersusernameDownloadsEAP_ENV_AmbientStationsEAP_ENV_AmbientStations.gdba0000000b.gdbtable", layer: "EAP_ENV_AmbientStations"
Driver: OpenFileGDB; number of rows: 557 
Feature type: wkbPoint with 2 dimensions
Extent: (623276.8 93472.33) - (2533932 1367270)
CRS: +proj=lcc +lat_1=47.33333333333334 +lat_2=45.83333333333334 +lat_0=45.33333333333334 +lon_0=-120.5 +x_0=500000.0001016001 +y_0=0 +ellps=GRS80 +towgs84=0,0,0,0,0,0,0 +units=us-ft +no_defs  
Number of fields: 22 
         name type length typeName
1     STATION    4      6   String
2     STANAME    4     35   String
3        WBID    4     10   String
... ')


a0000000b <-  readOGR("a0000000b.gdbtable")
writeOGR(a0000000b,dsn="EAP_ENV_AmbientStations.gdb",layer="EAP_ENV_AmbientStations_b",driver="ESRI Shapefile")

as.data.table(data.frame(a0000000b))[,names(.SD)]
 [1] "STATION"    "STANAME"    "WBID"       "DECOREGN"   "ECORGN"     "WATERSHED"  "GLACIAL"    "SPECIALCRI" "CORE"       "STRUCT"     "SURROUND"   "LOCATIONTY" "ELEV"       "RMI"        "LAT_DD"     "LONG_DD"    "TRS"        "QUAD"       "COUNTY"    
[20] "CONGDIST"   "LEGDIST"    "CLASS"      "coords.x1"  "coords.x2"  "optional" 

bubble(a0000000b['LAT_DD'], col=rgb(0.5,0.5,1,0.5)) 

以上是关于如何让rgdal打开地理数据库(.gdb)文件?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

QGIS入门实战精品教程005:QGIS如何打开ArcGIS创建的文件数据库(GDB)?

arcgis如何将注记从mdb导出到gdb数据库?

mdb如何转成ttl

可以讲一下arcgis中shp文件与gdb数据库在项目中应用的区别与联系否?3q

GIS Default.gdb有用吗 可以删除吗

如何在 GDB 中打开源文件