SQLAlchemy,Psycopg2和Postgresql COPY
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了SQLAlchemy,Psycopg2和Postgresql COPY相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
看起来Psycopg有一个用于执行COPY的自定义命令:
psycopg2 COPY using cursor.copy_from() freezes with large inputs
有没有办法从SQLAlchemy访问此功能?
您可能只需使用psycopg2来公开此功能并放弃ORM功能。我想我在这样的操作中并没有真正看到ORM的好处,因为它是一个直接的批量插入并处理单个对象,而ORM实际上并没有太多意义。
接受的答案是正确的,但如果你想要的不只是EoghanM的评论继续下面的工作,请将表格复制到CSV ...
from sqlalchemy import sessionmaker, create_engine
eng = create_engine("postgresql://user:pwd@host:5432/db")
ses = sessionmaker(bind=engine)
dbcopy_f = open('/tmp/some_table_copy.csv','wb')
copy_sql = 'COPY some_table TO STDOUT WITH CSV HEADER'
fake_conn = eng.raw_connection()
fake_cur = fake_conn.cursor()
fake_cur.copy_expert(copy_sql, dbcopy_f)
sessionmaker
不是必需的但是如果你习惯于创建引擎和会话同时使用raw_connection
你需要将它们分开(除非有某种方法通过会话对象访问引擎我不知道)。提供给copy_expert
的sql字符串也不是唯一的方法,有一个基本的copy_to
函数,你可以使用参数的子集,你可以通过正常的COPY
TO查询。对我来说命令的整体性能似乎很快,复制出约20000行的表。
http://initd.org/psycopg/docs/cursor.html#cursor.copy_to http://docs.sqlalchemy.org/en/latest/core/connections.html#sqlalchemy.engine.Engine.raw_connection
如果您的引擎配置了psycopg2连接字符串(这是默认设置,所以"postgresql://..."
或"postgresql+psycopg2://..."
),您可以使用SQL Alchemy会话创建一个psycopg2游标
cursor = session.connection().connection.cursor()
你可以用它来执行
cursor.copy_from(...)
光标将在与您当前会话相同的事务中处于活动状态。如果commit
或rollback
发生,任何进一步使用光标抛出psycopg2.InterfaceError
,你将不得不创建一个新的。
您可以使用:
def to_sql(engine, df, table, if_exists='fail', sep=' ', encoding='utf8'):
# Create Table
df[:0].to_sql(table, engine, if_exists=if_exists)
# Prepare data
output = cStringIO.StringIO()
df.to_csv(output, sep=sep, header=False, encoding=encoding)
output.seek(0)
# Insert data
connection = engine.raw_connection()
cursor = connection.cursor()
cursor.copy_from(output, table, sep=sep, null='')
connection.commit()
cursor.close()
我在5秒而不是4分钟内插入200000行
您不需要下拉到psycopg2,使用raw_connection也不需要光标。
像往常一样执行sql,你甚至可以使用text()
绑定参数:
engine.execute(text('''copy some_table from :csv
delimiter ',' csv'''
).execution_options(autocommit=True),
csv='/tmp/a.csv')
如果接受execution_options(autocommit=True)
,你可以放弃this PR
如果你可以到达引擎,你就拥有了所需的一切:
engine = create_engine('postgresql+psycopg2://myuser:password@localhost/mydb')
# or
engine = session.engine
# or any other way you know to get to the engine
现在你可以工作了。
# isolate a connection
connection = engine.connect().connection
# get the cursor
cursor = connection.cursor()
以下是与cursor.copy_expert()
一起使用的COPY语句的一些模板,这是一个比copy_from()
或copy_to()
更完整和更灵活的选项,如下所示:http://initd.org/psycopg/docs/cursor.html#cursor.copy_expert。
# to dump to a file
dump_to = """
COPY mytable
TO STDOUT
WITH (
FORMAT CSV,
DELIMITER ',',
HEADER
);
"""
# to copy from a file:
copy_from = """
COPY mytable
FROM STDIN
WITH (
FORMAT CSV,
DELIMITER ',',
HEADER
);
"""
查看上述选项的含义以及您的具体情况https://www.postgresql.org/docs/current/static/sql-copy.html可能感兴趣的其他选项。
重要说明:cursor.copy_expert()
文档的链接指示使用STDOUT写入文件,使用STDIN从文件复制。但是如果你看一下PostgreSQL手册上的语法,你会注意到你也可以直接在COPY语句中指定要写入或写入的文件。不要这样做,如果你不是以root身份运行(在开发过程中以root身份运行Python,那么你可能只是浪费时间?)只需执行psycopg2文档中指示的内容并使用cursor.copy_expert()
在语句中指定STDIN或STDOUT ,应该没问题。
# running the copy statement
with open('/path/to/your/data/file.csv') as f:
cursor.copy_expert(copy_from, file=f)
# don't forget to commit the changes.
connection.commit()
以上是关于SQLAlchemy,Psycopg2和Postgresql COPY的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
SQLAlchemy,Psycopg2和Postgresql COPY
如何使用 pandas sqlalchemy 和 psycopg2 处理 NaT
SQLAlchemy(psycopg2.ProgrammingError)无法适应类型'dict'
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