《纳米孔：生物分自相互作用传感基础》读书笔记

Posted 2023-02-02 maifansnet

1	纳米孔DNA测序方法至少要满足4个条件： 1.用于测序的通道和薄膜必须足够牢固，要可以耐受用来消除聚核苷酸二级结构影响所需的温度和化学反应。 2.纳米孔通道的长度必须与0.4mm的碱基间距在一个数量级以上（为了使DNA的易位速度恒定） 3.每种核苷酸必须要产生一种特征性的瞬态阻塞电流 4.碱基易位的速率必须要低于离子电流测量系统的时间分辨率
2	主要的DNA测序方法 1.KBBD 方案 2.横向电子传输 3.半导体纳米孔-电容器 4. 解旋所需DNA（荧光法） 5.杂交辅助纳米孔DNA测序 6.牛津纳米孔DNA测序
3	影响DNA易位速度的因素：溶液的黏度、外加偏执电压、盐浓度、溶液温度 增加黏度、减小外加偏执电流、减小离子浓度和降低温度可以降低DNA的易位速率。但同时也会减弱离子电流信号。
4	控制DNA易位速度的方法：光镊、磁镊、DNA晶体管
5	DNA的捕获速率R= 2 pai CDr  C为DNA的浓度 D 为自由溶液中DNA的扩散系数；  r为孔的捕获半径。
6	纳米孔中的DNA受三种力影响：电场力，作用域带负电荷的DNA链的磷酸盐骨架上；范德华力，与孔壁相互作用的静电力和非极性力；拉力。