MySQL ·InnoDB 文件系统之文件物理结构
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了MySQL ·InnoDB 文件系统之文件物理结构相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
从上层的角度来看,InnoDB层的文件,除了redo日志外,基本上具有相当统一的结构,都是固定block大小,普遍使用的btree结构来管理数据。只是针对不同的block的应用场景会分配不同的页类型。通常默认情况下,每个block的大小为 UNIV_PAGE_SIZE,在不做任何配置时值为16kb,你还可以选择在安装实例时指定一个块的block大小。对于压缩表,可以在建表时指定block size,但在内存中表现的解压页依旧为统一的页大小。
从物理文件的分类来看,有日志文件、主系统表空间文件ibdata、undo tablespace文件、临时表空间文件、用户表空间。
日志文件主要用于记录redo log,InnoDB采用循环使用的方式,你可以通过参数指定创建文件的个数和每个文件的大小。默认情况下,日志是以512字节的block单位写入。由于现代文件系统的block size通常设置到4k,InnoDB提供了一个选项,可以让用户将写入的redo日志填充到4KB,以避免read-modify-write的现象;而Percona Server则提供了另外一个选项,支持直接将redo日志的block size修改成指定的值。
ibdata是InnoDB最重要的系统表空间文件,它记录了InnoDB的核心信息,包括事务系统信息、元数据信息,记录InnoDB change buffer的btree,防止数据损坏的double write buffer等等关键信息。我们稍后会展开描述。
undo独立表空间是一个可选项,通常默认情况下,undo数据是存储在ibdata中的,但你也可以通过配置选项 innodb_undo_tablespaces 来将undo 回滚段分配到不同的文件中,目前开启undo tablespace 只能在install阶段进行。在主流版本进入5.7时代后,我们建议开启独立undo表空间,只有这样才能利用到5.7引入的新特效:online undo truncate。
mysql 5.7 新开辟了一个临时表空间,默认的磁盘文件命名为ibtmp1,所有非压缩的临时表都存储在该表空间中。由于临时表的本身属性,该文件在重启时会重新创建。对于云服务提供商而言,通过ibtmp文件,可以更好的控制临时文件产生的磁盘存储。
用户表空间,顾名思义,就是用于自己创建的表空间,通常分为两类,一类是一个表空间一个文件,另外一种则是5.7版本引入的所谓General Tablespace,在满足一定约束条件下,可以将多个表创建到同一个文件中。除此之外,InnoDB还定义了一些特殊用途的ibd文件,例如全文索引相关的表文件。而针对空间数据类型,也构建了不同的数据索引格式R-tree。
在关键的地方本文注明了代码函数,建议读者边参考代码边阅读本文,本文的代码部分基于MySQL 5.7.11版本,不同的版本函数名或逻辑可能会有所不同。请读者阅读本文时尽量选择该版本的代码。
文件管理页
InnoDB 的每个数据文件都归属于一个表空间,不同的表空间使用一个唯一标识的space id来标记。例如ibdata1, ibdata2… 归属系统表空间,拥有相同的space id。用户创建表产生的ibd文件,则认为是一个独立的tablespace,只包含一个文件。
每个文件按照固定的 page size 进行区分,默认情况下,非压缩表的page size为16Kb。而在文件内部又按照64个Page(总共1M)一个Extent的方式进行划分并管理。对于不同的page size,对应的Extent大小也不同,对应为:
尽管支持更大的Page Size,但目前还不支持大页场景下的数据压缩,原因是这涉及到修改压缩页中slot的固定size(其实实现起来也不复杂)。在不做声明的情况下,下文我们默认使用16KB的Page Size来阐述文件的物理结构。
为了管理整个Tablespace,除了索引页外,数据文件中还包含了多种管理页,如下图所示,一个用户表空间大约包含这些页来管理文件,下面会一一进行介绍。
InnoDB 管理页
文件链表
首先我们先介绍基于文件的一个基础结构,即文件链表。为了管理Page,Extent这些数据块,在文件中记录了许多的节点以维持具有某些特征的链表,例如在在文件头维护的inode page链表,空闲、用满以及碎片化的Extent链表等等。
在InnoDB里链表头称为FLST_BASE_NODE,大小为FLST_BASE_NODE_SIZE(16个字节)。BASE NODE维护了链表的头指针和末尾指针,每个节点称为FLST_NODE,大小为FLST_NODE_SIZE(12个字节)。相关结构描述如下:
FLST_BASE_NODE:
FLST_NODE:
如上所述,文件链表中使用6个字节来作为节点指针,指针的内容包括:
该链表结构是InnoDB表空间内管理所有page的基础结构,下图先感受下,具体的内容可以继续往下阅读。
InnoDB 表空间page管理
文件链表管理的相关代码参阅:include/fut0lst.ic, fut/fut0lst.cc
FSP_HDR PAGE
数据文件的第一个Page类型为FIL_PAGE_TYPE_FSP_HDR,在创建一个新的表空间时进行初始化(fsp_header_init),该page同时用于跟踪随后的256个Extent(约256MB文件大小)的空间管理,所以每隔256MB就要创建一个类似的数据页,类型为FIL_PAGE_TYPE_XDES ,XDES Page除了文件头部外,其他都和FSP_HDR页具有相同的数据结构,可以称之为Extent描述页,每个Extent占用40个字节,一个XDES Page最多描述256个Extent。
FSP_HDR页的头部使用FSP_HEADER_SIZE个字节来记录文件的相关信息,具体的包括:
在文件头使用FLAG(对应上述FSP_SPACE_FLAGS)描述了创建表时的如下关键信息:
除了上述描述信息外,其他部分的数据结构和XDES PAGE(FIL_PAGE_TYPE_XDES)都是相同的,使用连续数组的方式,每个XDES PAGE最多存储256个XDES Entry,每个Entry占用40个字节,描述64个Page(即一个Extent)。格式如下:
XDES_STATE表示该Extent的四种不同状态:
通过XDES_STATE信息,我们只需要一个FLIST_NODE节点就可以维护每个Extent的信息,是处于全局表空间的链表上,还是某个btree segment的链表上。
IBUF BITMAP PAGE
第2个page类型为FIL_PAGE_IBUF_BITMAP,主要用于跟踪随后的每个page的change buffer信息,使用4个bit来描述每个page的change buffer信息。
由于bitmap page的空间有限,同样每隔256个Extent Page之后,也会在XDES PAGE之后创建一个ibuf bitmap page。
关于change buffer,这里我们不展开讨论,感兴趣的可以阅读之前的这篇月报:
MySQL · 引擎特性 · Innodb change buffer介绍(http://mysql.taobao.org/monthly/2015/07/01/)
INODE PAGE
数据文件的第3个page的类型为FIL_PAGE_INODE,用于管理数据文件中的segement,每个索引占用2个segment,分别用于管理叶子节点和非叶子节点。每个inode页可以存储FSP_SEG_INODES_PER_PAGE(默认为85)个记录。
每个Inode Entry的结构如下表所示:
文件维护
从上文我们可以看到,InnoDB通过Inode Entry来管理每个Segment占用的数据页,每个segment可以看做一个文件页维护单元。Inode Entry所在的inode page有可能存放满,因此又通过头Page维护了Inode Page链表。
在ibd的第一个Page中还维护了表空间内Extent的FREE、FREE_FRAG、FULL_FRAG三个Extent链表;而每个Inode Entry也维护了对应的FREE、NOT_FULL、FULL三个Extent链表。这些链表之间存在着转换关系,以高效的利用数据文件空间。
当创建一个新的索引时,实际上构建一个新的btree(btr_create),先为非叶子节点Segment分配一个inode entry,再创建root page,并将该segment的位置记录到root page中,然后再分配leaf segment的Inode entry,并记录到root page中。
当删除某个索引后,该索引占用的空间需要能被重新利用起来。
创建Segment
首先每个Segment需要从ibd文件中预留一定的空间(fsp_reserve_free_extents),通常是2个Extent。但如果是新创建的表空间,且当前的文件小于1个Extent时,则只分配2个Page。
当文件空间不足时,需要对文件进行扩展(fsp_try_extend_data_file)。文件的扩展遵循一定的规则:如果当前小于1个Extent,则扩展到1个Extent满;当表空间小于32MB时,每次扩展一个Extent;大于32MB时,每次扩展4个Extent(fsp_get_pages_to_extend_ibd)。
在预留空间后,读取文件头Page并加锁(fsp_get_space_header),然后开始为其分配Inode Entry(fsp_alloc_seg_inode)。首先需要找到一个合适的inode page。
我们知道Inode Page的空间有限,为了管理Inode Page,在文件头存储了两个Inode Page链表,一个链接已经用满的inode page,一个链接尚未用满的inode page。如果当前Inode Page的空间使用完了,就需要再分配一个inode page,并加入到FSP_SEG_INODES_FREE链表上(fsp_alloc_seg_inode_page)。对于独立表空间,通常一个inode page就足够了。
当拿到目标inode page后,从该Page中找到一个空闲(fsp_seg_inode_page_find_free)未使用的slot(空闲表示其不归属任何segment,即FSEG_ID置为0)。
一旦该inode page中的记录用满了,就从FSP_SEG_INODES_FREE链表上转移到FSP_SEG_INODES_FULL链表。
获得inode entry后,递增头page的FSP_SEG_ID,作为当前segment的seg id写入到inode entry中。随后进行一些列的初始化。
在完成inode entry的提取后,就将该inode entry所在inode page的位置及页内偏移量存储到其他某个page内(对于btree就是记录在根节点内,占用10个字节,包含space id, page no, offset)。
Btree的根节点实际上是在创建non-leaf segment时分配的,root page被分配到该segment的frag array的第一个数组元素中。
Segment分配入口函数: fseg_create_general
分配数据页
随着btree数据的增长,我们需要为btree的segment分配新的page。前面我们已经讲过,segment是一个独立的page管理单元,我们需要将从全局获得的数据空间纳入到segment的管理中。
Step 1:空间扩展
当判定插入索引的操作可能引起分裂时,会进行悲观插入(btr_cur_pessimistic_insert),在做实际的分裂操作之前,会先对文件进行扩展,并尝试预留(tree_height / 16 + 3)个Extent,大多数情况下都是3个Extent。
这里有个意外场景:如果当前文件还不超过一个Extent,并且请求的page数小于1/2个Extent时,则如果指定page数,保证有2个可用的空闲Page,或者分配指定的page,而不是以Extent为单位进行分配。
注意这里只是保证有足够的文件空间,避免在btree操作时进行文件Extent。如果在这一步扩展了ibd文件(fsp_try_extend_data_file),新的数据页并未初始化,也未加入到任何的链表中。
在判定是否有足够的空闲Extent时,本身ibd预留的空闲空间也要纳入考虑,对于普通用户表空间是2个Extent + file_size * 1%。这些新扩展的page此时并未进行初始化,也未加入到,在头page的FSP_FREE_LIMIT记录的page no标识了这类未初始化页的范围。
Step 2:为segment分配page
随后进入索引分裂阶段(btr_page_split_and_insert),新page分配的上层调用栈:
在传递的参数中,有个hint page no,通常是当前需要分裂的page no的前一个(direction = FSP_DOWN)或者后一个page no(direction = FSP_UP),其目的是将逻辑上相邻的节点在物理上也尽量相邻。
在Step 1我们已经保证了物理空间有足够的数据页,只是还没进行初始化。将page分配到当前segment的流程如下(fseg_alloc_free_page_low):
1. 计算当前segment使用的和占用的page数
· 使用的page数存储包括FSEG_NOT_FULL链表上使用的page数(存储在inode entry的FSEG_NOT_FULL_N_USED中) + 已用满segment的FSEG_FULL链表上page数 + 占用的frag array page数量;
· 占用的page数包括FSEG_FREE、FSEG_NOT_FULL、FSEG_FULL三个链表上的Extent + 占用的frag array page数量。
2. 根据hint page获取对应的xdes entry (xdes_get_descriptor_with_space_hdr)
3. 当满足如下条件时该hint page可以直接拿走使用:
· Extent状态为XDES_FSEG,表示属于一个segment
· hint page所在的Extent已被分配给当前segment(检查xdes entry的XDES_ID)
· hint page对应的bit设置为free,表示尚未被占用
· 返回hint page
4. 当满足条件:1) xdes entry当前是空闲状态(XDES_FREE);2) 该segment中已使用的page数大于其占用的page数的7/8 (FSEG_FILLFACTOR);3) 当前segment已经使用了超过32个frag page,即表示其inode中的frag array可能已经用满。
· 从表空间分配hint page所在的Extent (fsp_alloc_free_extent),将其从FSP_FREE链表上移除
· 设置该Extent的状态为XDES_FSEG,写入seg id,并加入到当前segment的FSEG_FREE链表中。
· 返回hint page
5. 当如下条件时:1) direction != FSP_NO_DIR,对于Btree分裂,要么FSP_UP,要么FSP_DOWN;2)已使用的空间小于已占用空间的7/8; 3)当前segment已经使用了超过32个frag page
· 尝试从segment获取一个Extent(fseg_alloc_free_extent),如果该segment的FSEG_FREE链表为空,则需要从表空间分配(fsp_alloc_free_extent)一个Extent,并加入到当前segment的FSEG_FREE链表上
· direction为FSP_DOWN时,返回该Extent最后一个page,为FSP_UP时,返回该Extent的第一个Page
6. xdes entry属于当前segment且未被用满,从其中取一个空闲page并返回
7. 如果该segment占用的page数大于实用的page数,说明该segment还有空闲的page,则依次先看FSEG_NOT_FULL链表上是否有未满的Extent,如果没有,再看FSEG_FREE链表上是否有完全空闲的Extent。从其中取一个空闲Page并返回
8. 当前已经实用的Page数小于32个page时,则分配独立的page(fsp_alloc_free_page)并加入到该inode的frag array page数组中,然后返回该block
9. 当上述情况都不满足时,直接分配一个Extent(fseg_alloc_free_extent),并从其中取一个page返回。
上述流程看起来比较复杂,但可以总结为:
1. 对于一个新的segment,总是优先填满32个frag page数组,之后才会为其分配完整的Extent,可以利用碎片页,并避免小表占用太多空间。
2. 尽量获得hint page;
3. 如果segment上未使用的page太多,则尽量利用segment上的page。
上文提到两处从表空间为segment分配数据页,一个是分配单独的数据页,一个是分配整个Extent
表空间单独数据页的分配调用函数fsp_alloc_free_page:
1. 如果hint page所在的Extent在链表XDES_FREE_FRAG上,可以直接使用;否则从根据头page的FSP_FREE_FRAG链表查看是否有可用的Extent;
2. 未能从上述找到一个可用Extent,直接分配一个Extent,并加入到FSP_FREE_FRAG链表中;
3. 从获得的Extent中找到描述为空闲(XDES_FREE_BIT)的page。
4. 分配该page (fsp_alloc_from_free_frag)
· 设置page对应的bitmap的XDES_FREE_BIT为false,表示被占用;
· 递增头page的FSP_FRAG_N_USED字段;
· 如果该Extent被用满了,就将其从FSP_FREE_FRAG移除,并加入到FSP_FULL_FRAG链表中。同时对头Page的FSP_FRAG_N_USED递减1个Extent(FSP_FRAG_N_USED只存储未满的Extent使用的page数量);
· 对Page内容进行初始化(fsp_page_create)。
表空间Extent的分配函数fsp_alloc_free_extent:
1. 通常先通过头page看FSP_FREE链表上是否有空闲的Extent,如果没有的话,则将新的Extent(例如上述step 1对文件做扩展产生的新page,从FSP_FREE_LIMIT算起)加入到FSP_FREE链表上(fsp_fill_free_list):
· 一次最多加4个Extent(FSP_FREE_ADD);
· 如果涉及到xdes page,还需要对xdes page进行初始化;
· 如果Extent中存在类似xdes page这样的系统管理页,这个Extent被加入到FSP_FREE_FRAG链表中而不是FSP_FREE链表;
· 取链表上第一个Extent为当前使用;
2. 将获得的Extent从FSP_FREE移除,并返回对应的xdes entry(xdes_lst_get_descriptor)。
回收Page
数据页的回收分为两种,一种是整个Extent的回收,一种是碎片页的回收。在删除索引页或者drop索引时都会发生。
当某个数据页上的数据被删光时,我们需要从其所在segmeng上删除该page(btr_page_free -->fseg_free_page --> fseg_free_page_low),回收的流程也比较简单:
1. 首先如果是该segment的frag array中的page,将对应的slot设置为FIL_NULL, 并返还给表空间(fsp_free_page):
· page在xdes entry中的状态置为空闲;
· 如果page所在Extent处于FSP_FULL_FRAG链表,则转移到FSP_FREE_FRAG中;
· 如果Extent中的page完全被释放掉了,则释放该Extent(fsp_free_extent),将其转移到FSP_FREE链表;
· 从函数返回;
2. 如果page所处于的Extent当前在该segment的FSEG_FULL链表上,则转移到FSEG_NOT_FULL链表;
3. 设置Page在xdes entry的bitmap对应的XDES_FREE_BIT为true;
4. 如果此时该Extent上的page全部被释放了,将其从FSEG_NOT_FULL链表上移除,并加入到表空间的FSP_FREE链表上(而非Segment的FSEG_FREE链表)。
释放Segment
当我们删除索引或者表时,需要删除btree(btr_free_if_exists),先删除除了root节点外的其他部分(btr_free_but_not_root),再删除root节点(btr_free_root)
由于数据操作都需要记录redo,为了避免产生非常大的redo log,leaf segment通过反复调用函数fseg_free_step来释放其占用的数据页:
1. 首先找到leaf segment对应的Inode entry(fseg_inode_try_get);
2. 然后依次查找inode entry中的FSEG_FULL、或者FSEG_NOT_FULL、或者FSEG_FREE链表,找到一个Extent,注意着里的链表元组所指向的位置实际上是描述该Extent的Xdes Entry所在的位置。因此可以快速定位到对应的Xdes Page及Page内偏移量(xdes_lst_get_descriptor);
3. 现在我们可以将这个Extent安全的释放了(fseg_free_extent,见后文);
4. 当反复调用fseg_free_step将所有的Extent都释放后,segment还会最多占用32个碎片页,也需要依次释放掉(fseg_free_page_low)
5. 最后,当该inode所占用的page全部释放时,释放inode entry:
· 如果该inode所在的inode page中当前被用满,则由于我们即将释放一个slot,需要从FSP_SEG_INODES_FULL转移到FSP_SEG_INODES_FREE(更新第一个page);
· 将该inode entry的SEG_ID清除为0,表示未使用;
· 如果该inode page上全部inode entry都释放了,就从FSP_SEG_INODES_FREE移除,并删除该page。
non-leaf segment的回收和leaf segment的回收基本类似,但要注意btree的根节点存储在该segment的frag arrary的第一个元组中,该Page暂时不可以释放(fseg_free_step_not_header)
btree的root page在完成上述步骤后再释放,此时才能彻底释放non-leaf segment
索引页
ibd文件中真正构建起用户数据的结构是BTREE,在你创建一个表时,已经基于显式或隐式定义的主键构建了一个btree,其叶子节点上记录了行的全部列数据(加上事务id列及回滚段指针列);如果你在表上创建了二级索引,其叶子节点存储了键值加上聚集索引键值。本小节我们探讨下组成索引的物理存储页结构,这里默认讨论的是非压缩页,我们在下一小节介绍压缩页的内容。
每个btree使用两个Segment来管理数据页,一个管理叶子节点,一个管理非叶子节点,每个segment在inode page中存在一个记录项,在btree的root page中记录了两个segment信息。
当我们需要打开一张表时,需要从ibdata的数据词典表中load元数据信息,其中SYS_INDEXES系统表中记录了表,索引,及索引根页对应的page no(DICT_FLD__SYS_INDEXES__PAGE_NO),进而找到btree根page,就可以对整个用户数据btree进行操作。
索引最基本的页类型为FIL_PAGE_INDEX。可以划分为下面几个部分。
Page Header
首先不管任何类型的数据页都有38个字节来描述头信息(FIL_PAGE_DATA, or PAGE_HEADER),包含如下信息:
Index Header
紧随FIL_PAGE_DATA之后的是索引信息,这部分信息是索引页独有的。
Segment Info
随后20个字节描述段信息,仅在Btree的root Page中被设置,其他Page都是未使用的。
10个字节的inode信息包括:
通过上述信息,我们可以找到对应segment在inode page中的描述项,进而可以操作整个segment。
系统记录
之后是两个系统记录,分别用于描述该page上的极小值和极大值,这里存在两种存储方式,分别对应旧的InnoDB文件系统,及新的文件系统(compact page)
Compact的系统记录存储方式为:
两种格式的主要差异在于不同行存储模式下,单个记录的描述信息不同。在实际创建page时,系统记录的值已经初始化好了,对于老的格式(REDUNDANT),对应代码里的infimum_supremum_redundant,对于新的格式(compact),对应infimum_supremum_compact。infimum记录的固定heap no为0,supremum记录的固定Heap no 为1。page上最小的用户记录前节点总是指向infimum,page上最大的记录后节点总是指向supremum记录。
具体参考索引页创建函数:page_create_low
用户记录
在系统记录之后就是真正的用户记录了,heap no 从2(PAGE_HEAP_NO_USER_LOW)开始算起。注意Heap no仅代表物理存储顺序,不代表键值顺序。
根据不同的类型,用户记录可以是非叶子节点的Node指针信息,也可以是只包含有效数据的叶子节点记录。而不同的行格式存储的行记录也不同,例如在早期版本中使用的redundant格式会被现在的compact格式使用更多的字节数来描述记录,例如描述记录的一些列信息,在使用compact格式时,可以改为直接从数据词典获取。因为redundant属于渐渐被抛弃的格式,本文的讨论中我们默认使用Compact格式。在文件rem/rem0rec.cc的头部注释描述了记录的物理结构。
每个记录都存在rec header,描述如下(参阅文件include/rem0rec.ic)
在记录头信息之后的数据视具体情况有所不同:
· 对于聚集索引记录,数据包含了事务id,回滚段指针;
· 对于二级索引记录,数据包含了二级索引键值以及聚集索引键值。如果二级索引键和聚集索引有重合,则只保留一份重合的,例如pk (col1, col2),sec key(col2, col3),在二级索引记录中就只包含(col2, col3, col1);
· 对于非叶子节点页的记录,聚集索引上包含了其子节点的最小记录键值及对应的page no;二级索引上有所不同,除了二级索引键值外,还包含了聚集索引键值,再加上page no三部分构成。
Free space
这里指的是一块完整的未被使用的空间,范围在页内最后一个用户记录和Page directory之间。通常如果空间足够时,直接从这里分配记录空间。当判定空闲空间不足时,会做一次Page内的重整理,以对碎片空间进行合并。
Page directory
为了加快页内的数据查找,会按照记录的顺序,每隔4~8个数量(PAGE_DIR_SLOT_MIN_N_OWNED ~ PAGE_DIR_SLOT_MAX_N_OWNED)的用户记录,就分配一个slot (每个slot占用2个字节,PAGE_DIR_SLOT_SIZE),存储记录的页内偏移量,可以理解为在页内构建的一个很小的索引(sparse index)来辅助二分查找。
Page Directory的slot分配是从Page末尾(倒数第八个字节开始)开始逆序分配的。在查询记录时。先根据page directory 确定记录所在的范围,然后在据此进行线性查询。
增加slot的函数参阅 page_dir_add_slot
页内记录二分查找的函数参阅 page_cur_search_with_match_bytes
FIL Trailer
在每个文件页的末尾保留了8个字节(FIL_PAGE_DATA_END or FIL_PAGE_END_LSN_OLD_CHKSUM),其中4个字节用于存储page checksum,这个值需要和page头部记录的checksum相匹配,否则认为page损坏(buf_page_is_corrupted)
压缩索引页
InnoDB当前存在两种形式的压缩页,一种是Transparent Page Compression,还有一种是传统的压缩方式,下文分别进行阐述。
Transparent Page Compression
这是MySQL5.7新加的一种数据压缩方式,其原理是利用内核Punch hole特性,对于一个16kb的数据页,在写文件之前,除了Page头之外,其他部分进行压缩,压缩后留白的地方使用punch hole进行 “打洞”,在磁盘上表现为不占用空间 (但会产生大量的磁盘碎片)。 这种方式相比传统的压缩方式具有更好的压缩比,实现逻辑也更加简单。
对于这种压缩方式引入了新的类型FIL_PAGE_COMPRESSED,在存储格式上略有不同,主要表现在从FIL_PAGE_FILE_FLUSH_LSN开始的8个字节被用作记录压缩信息:
打洞后的page其实际存储空间需要是磁盘的block size的整数倍。
这里我们不展开阐述,具体参阅我之前写的这篇文章:MySQL · 社区动态 · InnoDB Page Compression(http://mysql.taobao.org/monthly/2015/08/01/)
传统压缩存储格式
当你创建或修改表,指定row_format=compressed key_block_size=1|2|4|8 时,创建的ibd文件将以对应的block size进行划分。例如key_block_size设置为4时,对应block size为4kb。
压缩页的格式可以描述如下表所示:
在内存中通常存在压缩页和解压页两份数据。当对数据进行修改时,通常先修改解压页,再将DML操作以一种特殊日志的格式记入压缩页的mlog中。以减少被修改过程中重压缩的次数。主要包含这几种操作:
· Insert: 向mlog中写入完整记录
· Update:
· Delete-insert update,将旧记录的dense slot标记为删除,再写入完整新记录
· In-place update,直接写入新更新的记录
· Delete: 标记对应的dense slot为删除
页压缩参阅函数 page_zip_compress
页解压参阅函数 page_zip_decompress
系统数据页
这里我们将所有非独立的数据页统称为系统数据页,主要存储在ibdata中,如下图所示:
InnoDB 系统数据页
ibdata的三个page和普通的用户表空间一样,都是用于维护和管理文件页。其他Page我们下面一一进行介绍。
FSP_IBUF_HEADER_PAGE_NO
Ibdata的第4个page是Change Buffer的header page,类型为FIL_PAGE_TYPE_SYS,主要用于对ibuf btree的Page管理。
FSP_IBUF_TREE_ROOT_PAGE_NO
用于存储change buffer的根page,change buffer目前存储于Ibdata中,其本质上也是一颗btree,root页为固定page,也就是Ibdata的第5个page。
IBUF HEADER Page 和Root Page联合起来对ibuf的数据页进行管理。
首先Ibuf btree自己维护了一个空闲Page链表,链表头记录在根节点中,偏移量在PAGE_BTR_IBUF_FREE_LIST处,实际上利用的是普通索引根节点的PAGE_BTR_SEG_LEAF字段。Free List上的Page类型标示为FIL_PAGE_IBUF_FREE_LIST
每个Ibuf page重用了PAGE_BTR_SEG_LEAF字段,以维护IBUF FREE LIST的前后文件页节点(PAGE_BTR_IBUF_FREE_LIST_NODE)。
由于root page中的segment字段已经被重用,因此额外的开辟了一个Page,也就是Ibdata的第4个page来进行段管理。在其中记录了ibuf btree的segment header,指向属于ibuf btree的inode entry。
关于ibuf btree的构建参阅函数 btr_create
FSP_TRX_SYS_PAGE_NO/FSP_FIRST_RSEG_PAGE_NO
ibdata的第6个page,记录了InnoDB重要的事务系统信息,主要包括:
在5.7版本中,回滚段既可以在ibdata中,也可以在独立undo表空间,或者ibtmp临时表空间中,一个可能的分布如下图所示(摘自我之前的这篇文章[http://mysql.taobao.org/monthly/2015/04/01/])。
InnoDB Undo 回滚段结构
由于是在系统刚启动时初始化事务系统,因此第0号回滚段头页总是在ibdata的第7个page中。
事务系统创建参阅函数 trx_sysf_create
InnoDB最多可以创建128个回滚段,每个回滚段需要单独的Page来维护其拥有的undo slot,Page类型为FIL_PAGE_TYPE_SYS。描述如下:
回滚段头页的创建参阅函数 trx_rseg_header_create
实际存储undo记录的Page类型为FIL_PAGE_UNDO_LOG,undo header结构如下
undo页内结构及其与回滚段头页的关系参阅下图:
InnoDB Undo 页内结构
关于具体的Undo log如何存储,本文不展开描述,可阅读我之前的这篇文章:MySQL · 引擎特性 · InnoDB undo log 漫游(http://mysql.taobao.org/monthly/2015/04/01/)
FSP_DICT_HDR_PAGE_NO
ibdata的第8个page,用来存储数据词典表的信息 (只有拿到数据词典表,才能根据其中存储的表信息,进一步找到其对应的表空间,以及表的聚集索引所在的page no)
Dict_Hdr Page的结构如下表所示:
dict_hdr页的创建参阅函数 dict_hdr_create
double write buffer
InnoDB使用double write buffer来防止数据页的部分写问题,在写一个数据页之前,总是先写double write buffer,再写数据文件。当崩溃恢复时,如果数据文件中page损坏,会尝试从dblwr中恢复。
double write buffer存储在ibdata中,你可以从事务系统页(ibdata的第6个page)获取dblwr所在的位置。总共128个page,划分为两个block。由于dblwr在安装实例时已经初始化好了,这两个block在Ibdata中具有固定的位置,Page64 ~127 划属第一个block,Page 128 ~191划属第二个block。
在这128个page中,前120个page用于batch flush时的脏页回写,另外8个page用于SINGLE PAGE FLUSH时的脏页回写。
外部存储页
对于大字段,在满足一定条件时InnoDB使用外部页进行存储。外部存储页有三种类型:
1. FIL_PAGE_TYPE_BLOB:表示非压缩的外部存储页,结构如下图所示:
2. FIL_PAGE_TYPE_ZBLOB:压缩的外部存储页,如果存在多个blob page,则表示第一个
FIL_PAGE_TYPE_ZBLOB2:如果存在多个压缩的blob page,则表示blob链随后的page;
结构如下图所示:
而在记录内只存储了20个字节的指针以指向外部存储页,指针描述如下:
外部页的写入参阅函数 btr_store_big_rec_extern_fields
MySQL5.7新数据页:加密页及R-TREE页
MySQL 5.7版本引入了新的数据页以支持表空间加密及对空间数据类型建立R-TREE索引。本文对这种数据页不做深入讨论,仅仅简单描述下,后面我们会单独开两篇文章分别进行介绍。
数据加密页
从MySQL5.7.11开始InnoDB支持对单表进行加密,因此引入了新的Page类型来支持这一特性,主要加了三种Page类型:
· FIL_PAGE_ENCRYPTED:加密的普通数据页
· FIL_PAGE_COMPRESSED_AND_ENCRYPTED:数据页为压缩页(transparent page compression) 并且被加密(先压缩,再加密)
· FIL_PAGE_ENCRYPTED_RTREE:GIS索引R-TREE的数据页并被加密
对于加密页,除了数据部分被替换成加密数据外,其他部分和大多数表都是一样的结构。
加解密的逻辑和Transparent Compression类似,在写入文件前加密(os_file_encrypt_page --> Encryption::encrypt),在读出文件时解密数据(os_file_io_complete --> Encryption::decrypt)
秘钥信息存储在ibd文件的第一个page中(fsp_header_init --> fsp_header_fill_encryption_info),当执行SQL ALTER INSTANCE ROTATE INNODB MASTER KEY时,会更新每个ibd存储的秘钥信息(fsp_header_rotate_encryption)
默认安装时,一个新的插件keyring_file被安装并且默认Active,在安装目录下,会产生一个新的文件来存储秘钥,位置在$MYSQL_INSTALL_DIR/keyring/keyring,你可以通过参数keyring_file_data来指定秘钥的存放位置和文件命名。 当你安装多实例时,需要为不同的实例指定keyring文件。
开启表加密的语法很简单,在CREATE TABLE或ALTER TABLE时指定选项ENCRYPTION=‘Y’来开启,或者ENCRYPTION=‘N’来关闭加密。
关于InnoDB表空间加密特性,参阅该commit及官方文档。
R-TREE索引页
在MySQL 5.7中引入了新的索引类型R-TREE来描述空间数据类型的多维数据结构,这类索引的数据页类型为FIL_PAGE_RTREE。
R-TREE的相关设计参阅官方WL#6968, WL#6609, WL#6745
临时表空间ibtmp
MySQL5.7引入了临时表专用的表空间,默认命名为ibtmp1,创建的非压缩临时表都存储在该表空间中。系统重启后,ibtmp1会被重新初始化到默认12MB。你可以通过设置参数innodb_temp_data_file_path来修改ibtmp1的默认初始大小,以及是否允许autoExtent。默认值为 “ibtmp1:12M:autoExtent”。
除了用户定义的非压缩临时表外,第1~32个临时表专用的回滚段也存放在该文件中(0号回滚段总是存放在ibdata中)(trx_sys_create_noredo_rsegs),
日志文件ib_logfile
关于日志文件的格式,网上已经有很多的讨论,在之前的系列文章中我也有专门介绍过,本小节主要介绍下MySQL5.7新的修改。
首先是checksum算法的改变,当前版本的MySQL5.7可以通过参数innodb_log_checksums来开启或关闭redo checksum,但目前唯一支持的checksum算法是CRC32。而在之前老版本中只支持效率较低的InnoDB本身的checksum算法。
第二个改变是为Redo log引入了版本信息(WL#8845),存储在ib_logfile的头部,从文件头开始,描述如下
每次切换到下一个iblogfile时,都会更新该文件头信息(log_group_file_header_flush)
新的版本支持兼容老版本(recv_find_max_checkpoint_0),但升级到新版本后,就无法在异常状态下in-place降级到旧版本了(除非做一次clean的shutdown,并清理掉iblogfile)。
以上是关于MySQL ·InnoDB 文件系统之文件物理结构的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
MySQL · 性能优化· InnoDB buffer pool flush策略漫谈