用R读取TCGA数据库之json文件

Posted 2021-04-30 医知圈

 安装rjson包

在R语言控制台中，您可以发出以下命令来安装rjson包。

install.packages("rjson")

读取JSON文件

JSON文件由R使用来自JSON()的函数读取。 它作为列表存储在R中。

# Load the package required to read JSON files.
library("rjson")

# Give the input file name to the function.
result <- fromJSON(file = "input.json")

将JSON转换为数据帧

我们可以使用as.data.frame()函数将上面提取的数据转换为R语言数据帧以进行进一步分析。

# Load the package required to read JSON files.
library("rjson")

# Give the input file name to the function.
result <- fromJSON(file = "input.json")

# Convert JSON file to a data frame.
json_data_frame <- as.data.frame(result)

print(json_data_frame)

结果显示就是整理好的临床数据，方面整理哦

其实tableau软件也很强大，可以直接读取作图，大家自个去研究。