学员问Can't locate DBD/SQLite.pm in @INC 怎么解决？

Posted 2021-04-30 基因课

学员@彤馨小雅 问：遇到下面错误是什么原因，怎么解决？

解答：
简单的来说，遇到以上的报错信息，说明在 @INC 中找不到 DBD::SQLite 这个 Perl 模块。

can't locate DBD/SQLite.pm in @INC

解决办法：

conda install perl-dbd-sqlite

下面帮你理解下：
其中 @INC，是 Perl 语言中的一个内置变量（就像 @ARGV 是内置变量一样），这个数组里存储的是到哪些目录去寻找 Perl 模块（类似 shell 里的环境变量 $PATH）。

R 中与 @INC、PATH 类似的是 R_LIBS; python 中类似的是 PYTHONPATH。
对于学生物的人来说，管理这些环境变量非常复杂。我的办法是 conda 搞定一切。conda 安装的 Perl 模块、R 包、python 模块，会自动放到环境变量中。

不要再用 cpanm 安装 perl 模块，更不要手动安装。

学习生物信息过程中遇到问题，来基因课讨论区（http://www.genek.tv/group/7）提问，有问必答。