糖组学 | GlycanAnalyzer：N-聚糖结构分析软件

Posted 2021-04-26 食品组学

GlycanAnalyzer:基于外切糖苷酶的N-聚糖结构分析软件

     N-聚糖是糖蛋白中与蛋白质共价结合的碳水化合物，由于N-聚糖具有不同的分支度、拓扑结构和连接方式，因此在其完整结构表征方面仍存在一定困难。该文章介绍了一个网络应用程序GlycanAnalyzer (http://glycananalyzer.neb.com/)，可通过外切糖苷酶的连续催化来表征N-聚糖结构。利用外切糖苷酶特异性切除聚糖末端单糖后，预测聚糖在HPLC/UPLC和MS中的特征峰的位移，从而验证N-聚糖的精细结构（精确到单糖的序列和糖苷键的连接位置与异构类型），并在UPLC-MS色谱图中自动注释。用一种单克隆抗体和四种聚糖标准物验证了GlycanAnalyzer的分析准确性并与其他分析软件进行对比，结果表明GlycanAnalyzer的表征准确度高达100%，高于次优分析软件(UNIFI)的82%。

                       校审：石菲菲

参考文献

Wals hI,Nguyen-Khuong T, Wongtrakul-Kish K, et al. GlycanAnalyzer: software forautomated interpretation of N-glycan profiles after exoglycosidasedigestions[J]. Bioinformatics. 2019, 35(4): 688-690

   

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