R语言篇:R包的安装

Posted 2021-04-18 自学生信

  上一篇简单介绍了如何在集群上搭建自己的R环境，本篇将继续在R环境中如何快速的安装R工具包。

一. 从镜像直接安装（推荐,依赖包会一起安装）

  无论是在RGui或者Rstudio中都可以使用如下命令来安装R包,以heatmaply为例:

>>install.packages("heatmaply")

>>installed.packages() #查看已经安装的包

>>remove.package("包名") #移除已经安装的包

二.下载到本地安装

按名称排序:https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html

按日期排序:https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_date.html

2. 下载

进入到包的列表页面,ctrl+F检索自己想要下载的包名称:

图一. 包列表页面

点击进入包的详情页:

图二. 包的详情页面

选择packages source，点击下载。

3. 安装

>>install.packages("/home/zxsx/Renv/source/heatmaply_1.11.tar.gz",repos=NULL,type="source") #第一个参数是包的路径

三.安装github上的包

注: 前面两种方式都找不到的包可以尝试此种方法。

1. 预先安装devtools

>>install.packages("devtools")

2. 加载devtools包

>>library(devtools)

3. 利用devtools的install_github安装github上的包

图三. d3heatmap的github页面

>>install_github("rstudio/d3heatmap")

安装完成。