Perl中的文件读写

Posted 2021-04-17 生物信息学习

    我们先来看看在Perl中如何读文件：open IN, "filename";

    在Perl中如何写文件：open OUT,">finename";

    其中大写的字符串叫做文件句柄。

    –      文件句柄(filehand)是perl程序与外界的I/O联系的名称，而不是文件的名称。

    –      文件句柄的命名：与变量标识符类似，但建议文件句柄用大写。

打开文件句柄：

    open CONF, ‘gene';       #读取名为gene的文件，文件句柄命名为CONF

    open CONF, '<gene';     #或者在文件名前加个<

    open BLOCK,‘>SNP’;      #输出名为SNP的文件，文件句柄命名为 BLOCK。它用来创建一个新建文件，将输出送到名为SNP的新文件；如果SNP已经存在，那么会清除原有的内容并且以新的内容取代之。

    open LOG,‘>>result’;     #追加写入名为result的文件，文件句柄命名为LOG。如果文件原本就存在，那么新的数据将会添加在原有文件内容的后面；如果它不存在，就会创建一个新文件，和只有一个大于符号的情况类似。

关闭文件句柄：

 close filehand;

 异常处理函数：

•       open 函数返回文件打开是否成功（1或0）。当待读入的文件不存在，或者待写入的文件不可写时，文件打开会失败。

•       用die处理致命错误：产生标准错误输出并立即终止程序。$!变量用来存储错误信息。

•       用warn产生警告，但是不终止程序

用 <filehandle>读入文本文件

–      一般按行读入文件，用循环结构依次处理每一行

–      <filehandle>读入字符串默认保存在系统变量$_ 中

–      可以用chomp或chop函数去掉换行符

用print filehandle 写出到文本文件

处理文本文件的常用格式

恭喜你，又学到了新知识。