perl文本条件筛选
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了perl文本条件筛选相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
PERL 文本处理小案例
现有拟南芥若干基因以及对应的基因长度和GC含量,将GC含量大于0.45的基因挑选出来,并写入新的文件 ,文件格式如:
代码
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
open(IN,"Ath.len.GC.txt")or die("Can not open number.txt for reading:$!");
open(OUT, ">Ath.len.GC.over0.45.txt") or die ("Can not write to out.txt: $!");
my @line;
while(<IN>){
@line = split /\s+/, $_;
if($line[2]>0.45){
print OUT"$line[0]\t$line[2]\n";
}
}
close (IN);
close (OUT);
提取文件
以上是关于perl文本条件筛选的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章