mrMLM-qsub
Posted 萧飒
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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了mrMLM-qsub相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
注意表型首行使用标签<Trait>
脚本mrmlm.r
#!/public/home/caisl/biosoft/miniconda3/envs/r4.1/bin/R
library(\'mrMLM\')
mrMLM(fileGen=\'184.hmp.txt\',filePhe=\'pheno\',Genformat=\'Hmp\',method=c("mrMLM","FASTmrMLM","FASTmrEMMA"),trait=1:8,CriLOD=3,DrawPlot=TRUE,Plotformat=\'jpeg\',dir="/public/home/caisl/lee/gwas/cold184/mrmlm/result/")
#首行为R的路径
qsub脚本
#PBS -N mrMLM
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -q middle
cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`
/public/home/caisl/biosoft/miniconda3/envs/r4.1/bin/Rscript mrmlm.r
以上是关于mrMLM-qsub的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章