温州大学《机器学习》课程代码朴素贝叶斯

Posted 2021-04-23 机器学习初学者

机器学习练习4 朴素贝叶斯

代码修改并注释：黄海广，[e-mail]

代码下载：

https://github.com/fengdu78/WZU-machine-learning-course

1．朴素贝叶斯法是典型的生成学习方法。生成方法由训练数据学习联合概率分布 ，然后求得后验概率分布 。具体来说，利用训练数据学习 和 的估计，得到联合概率分布：

概率估计方法可以是极大似然估计或贝叶斯估计。

2．朴素贝叶斯法的基本假设是条件独立性，

这是一个较强的假设。由于这一假设，模型包含的条件概率的数量大为减少，朴素贝叶斯法的学习与预测大为简化。因而朴素贝叶斯法高效，且易于实现。其缺点是分类的性能不一定很高。

3．朴素贝叶斯法利用贝叶斯定理与学到的联合概率模型进行分类预测。

将输入 分到后验概率最大的类 。

后验概率最大等价于0-1损失函数时的期望风险最小化。

模型：

• 高斯模型
• 多项式模型
• 伯努利模型

import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split
from collections import Counter
import math

# data
def create_data():
    iris = load_iris()
    df = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
    df['label'] = iris.target
    df.columns = [
        'sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width', 'label'
    ]
    data = np.array(df.iloc[:100, :])
    # print(data)
    return data[:, :-1], data[:, -1]

X, y = create_data()
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3)

X_test[0], y_test[0]

(array([5.1, 3.8, 1.9, 0.4]), 0.0)

参考：https://machinelearningmastery.com/naive-bayes-classifier-scratch-python/

GaussianNB 高斯朴素贝叶斯

特征的可能性被假设为高斯

概率密度函数：

数学期望(mean)：

方差：

class NaiveBayes:
    def __init__(self):
        self.model = None

    # 数学期望
    @staticmethod
    def mean(X):
        return sum(X) / float(len(X))

    # 标准差（方差）
    def stdev(self, X):
        avg = self.mean(X)
        return math.sqrt(sum([pow(x - avg, 2) for x in X]) / float(len(X)))

    # 概率密度函数
    def gaussian_probability(self, x, mean, stdev):
        exponent = math.exp(-(math.pow(x - mean, 2) /
                              (2 * math.pow(stdev, 2))))
        return (1 / (math.sqrt(2 * math.pi) * stdev)) * exponent

    # 处理X_train
    def summarize(self, train_data):
        summaries = [(self.mean(i), self.stdev(i)) for i in zip(*train_data)]
        return summaries

    # 分类别求出数学期望和标准差
    def fit(self, X, y):
        labels = list(set(y))
        data = {label: [] for label in labels}
        for f, label in zip(X, y):
            data[label].append(f)
        self.model = {
            label: self.summarize(value)
            for label, value in data.items()
        }
        return 'gaussianNB train done!'

    # 计算概率
    def calculate_probabilities(self, input_data):
        # summaries:{0.0: [(5.0, 0.37),(3.42, 0.40)], 1.0: [(5.8, 0.449),(2.7, 0.27)]}
        # input_data:[1.1, 2.2]
        probabilities = {}
        for label, value in self.model.items():
            probabilities[label] = 1
            for i in range(len(value)):
                mean, stdev = value[i]
                probabilities[label] *= self.gaussian_probability(
                    input_data[i], mean, stdev)
        return probabilities

    # 类别
    def predict(self, X_test):
        # {0.0: 2.9680340789325763e-27, 1.0: 3.5749783019849535e-26}
        label = sorted(self.calculate_probabilities(X_test).items(),
                       key=lambda x: x[-1])[-1][0]
        return label

    def score(self, X_test, y_test):
        right = 0
        for X, y in zip(X_test, y_test):
            label = self.predict(X)
            if label == y:
                right += 1

        return right / float(len(X_test))

model = NaiveBayes()

model.fit(X_train, y_train)

'gaussianNB train done!'

print(model.predict([4.4,  3.2,  1.3,  0.2]))

0.0

model.score(X_test, y_test)

1.0

scikit-learn实例

from sklearn.naive_bayes import GaussianNB, BernoulliNB, MultinomialNB
# 高斯模型、伯努利模型和多项式模型

clf = GaussianNB()
clf.fit(X_train, y_train)

GaussianNB(priors=None, var_smoothing=1e-09)

clf.score(X_test, y_test)

1.0

clf.predict([[4.4,  3.2,  1.3,  0.2]])

array([0.])

参考

• Prof. Andrew Ng. Machine Learning. Stanford University
• 李航，《统计学习方法》，清华大学出版社