Enrichment Factor (EF) Analysis - [富集因子法]

Posted 2023-03-22

参考技术A 富集因子法常用于大气化学中，用于对大气中金属的自然起源和人类起源进行分类。

通过富集因子(EF)分析，可以确定人为因素对颗粒物中相关元素浓度的影响。基于大陆地壳上层的平均化学成份，Al 作为地壳元素，可以被用作参考元素。地壳元素含量参考中国表层土壤元素含量。（Al，Fe和Ti等都可以作为参考元素）。

公式原理如下：

其中 CX和 CR分别是研究关注的元素和参考元素的浓度。crust代表地壳，aerosol代表研究测量的大气气溶胶。如EF值>10,我们认为研究关注的元素与人类活动有关，如机动车尾气，金属制造等；如EF值接近于1，则认为研究的元素主要来自地壳源；如1<EF 值<10，则认为研究元素主要受地壳源的影响，但也受人为活动的影响。

功能的显著性分析——GO Enrichment Analysis

    Gene Ontology（GO）是基因功能国际标准分类体系。GO富集分析是对差异基因等按GO分类，并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、错判率分析、富集度分析，得到与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类，该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别。在芯片的数据分析中，研究者可以找出哪些变化基因属于一个共同的GO功能分支，并用统计学方法检定结果是否具有统计学意义，从而得出变化基因主要参与了哪些生物功能。

1.      对mRNA进行显著性功能富集分析，得到具有显著性、靶向性的功能以及显著性功能对应的靶基因。（功能富集）
 

2.      对富集得到的显著性功能以柱状图的形式展示。（功能柱状图）
 

3.      对富集得到的显著性功能以点图的形式展示。（功能点图）