No.1初走生信路：bash最常用的三个命令

Posted 2021-05-02 陈同学简单说

从本科到研究生，好像是被人猛推了一把，踉踉跄跄地半步踏入社会。

大老板脾气好，小老板性格棒想法多，可惜自己做试验太差了，磨磨唧唧，不是这边出问题，就是结果不理想，可是不做试验怎么毕业啊。。。。难道交给公司吗？！

好在作为医学生，只要肯干，标本总是有的，TCGA上的数据全可以共享，16S测序也火到不要不要，机会还是很多的……

找了一个学习生信师姐可以教教我，于是就草率决定开始零基础学习生信啦~~

今天分享的是刚刚学到的最基础最基础的BASH~~哈哈哈~~

1.首先肯定要先找到界面在哪里啦~~

因为OS 系统，这里只分享OS下怎么进入终端的详细过程，Windows系统请自行下载并研究SSH secure shell client

-点击‘应用程序’--‘其他’---‘终端’

-然后就出现了这个界面

2.主要介绍最简单的也最常用的命令喽~~毕竟是初学。。。我学习的时候参考的是这个链接

10 分钟学会Linux常用 bash命令（链接到阅读原文里啦）

（1）ls大法好

--输入ls，可以列出文件

---当然，ls还可以有很多选项，比如-l/-a等，有兴趣请自行探索，作为菜鸟就不误人子弟了

（2）cd

--cd就好像是一个箭头，指引着要去往的方向，配合ls使用效果更佳哟。这里ls列出了文件名，cd + 某个文件名后，就好像化身为一个小人，跳进了这个文件夹。比如这里cd Desktop后，我们就进入了Desktop这个文件夹

---换一下，假如输入cd Documents，进入了 Documents文件夹，如果再次输入ls，就可以展示 Documents文件夹里的有哪些文件了

  tips：如果想要返回上一层只需要输入‘cd ..’ 即可哦~~

（3）pwd

想象自己是个看不见的小人在文件夹之间跳跃，跳着跳着就不知道自己在哪里了^ _ ^这个时候就需要pwd来告诉你目前所在的目录

--输入pwd后

～～原来是在/Users/Jane/Documents这个目录呀

下回预告：如何从GEO下载二代测序的数据

～师姐说准备教我二代测序数据分析～～等我学会了整理一下就来写