时间序列~动态时间规整(Dynamic Time Wraping)

Posted 热爱科技的刘同学

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时间序列-动态时间规整(Dynamic Time Wraping)

文章目录

一、解决的问题

测量两端时间序列的相似性。

在语音识别中,特别是单音节的识别中,每个人说话时间长短不同,导致时间序列长度不同。DTW算法就是将某些数据点的时间Wrap到另一个时间序列的某些数据点,以辅助计算相似性。

二、算法设计

1.规则

  • 两端对齐
  • 一个点可以对应另一序列的多个点(允许重合对应)
  • 每一对数据点对齐不可交叉(只能向前对应)

2.成本矩阵

  • 有两不同长度时间序列
    X = x 1 , x 2 , . . . . . . , x n X=x_1,x_2,......,x_n X=x1,x2,......,xn
    Y = y 1 , y 2 , . . . . . . , y m Y=y_1,y_2,......,y_m Y=y1,y2,......,ym

  • 构建距离矩阵
    D N × M D_N×_M DN×M
    矩阵元素
    d i j = d i s t ( x i , y i ) d_ij=dist(x_i,y_i) dij=dist(xi,yi)
    dist通常采用欧氏距离


  • 在矩阵D中搜索从 d 1 1 d_11 d11 d ( n m ) d_(nm_) d(nm)之间的最短路径(采用动态规划搜索算法,向右、上、右上三个方向搜索);
  • 这个最短路径的和作为XY之间的相似度。

三、代码实现

'''
@Author: Classmate.Liu loved Technology
@Date: 2022-10-01 08:33:00
@LastEditTime: 2022-10-01 09:40:22
@FilePath: D:\\A\\Project_1\\main_5.py
'''
# import package
from importlib.resources import path
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

np.random.seed(42)

# define operation functions (including lambda expressions)
def DTW(X, Y, distance = lambda a, b: np.linalg.norm(a -b)):
    ''' dynamic time warping '''
    N, M = len(X), len(Y)
    cost = np.ones([N, M]) * np.inf
    for i in range(N):
        for j in range(M):
            dist_ij = distance(X[i], Y[j])
            dist_pr = min(cost[i - 1, j] if i-1>=0 else np.inf, cost[i, j-1] if j-1>=0 else np.inf, cost[i, j-1] if j-1>=0 and i+1>=0 else np.inf)
            cost[i, j] = dist_ij + (dist_pr if dist_pr < np.inf else 0)
        
        # traced back cost matrix to get minimum distance path
        i, j = N - 1, M - 1
        path = [(i, j)]
        while i > 0 or j > 0:
            condidate = []
            if i-1>=0:
                condidate.append((cost[i-1, j], (i-1, j)))
            if j-1>=0:
                condidate.append((cost[i, j-1], (i, j-1)))
            if i-1>=0 or j-1>=0:
                condidate.append((cost[i-1, j-1], (i-1, j-1)))
            i, j = min(condidate)[1]
            path.append((i, j))
        
        return cost[N-1, M-1], path

g_X = np.random.uniform(size=18)
g_Y = np.random.uniform(size=16) + 3.0

dist, path = DTW(g_X, g_Y)
print('Dist(X, Y) = ', dist)

plt.plot(g_X)
plt.plot(g_Y)
for ij in path:
    plt.plot(ij[0], ij[1]),
[g_X[ij[0]], g_Y[ij[1]], 'gray']
plt.show()


四、运行结果


图一:窗体运行结果



图二:终端运行结果

五、性能优化

  • 绝大多数最短距离不会偏离对角线太远;

  • 先在低精度下确定轮廓,随后在轮廓内计算更高精度路径。

以上是关于时间序列~动态时间规整(Dynamic Time Wraping)的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

DTW 笔记: Dynamic Time Warping 动态时间规整 (&DTW的python实现)

如何使用动态时间规整获得距离矩阵?

离散序列的一致性度量方法:动态时间规整(DTW)

动态时间规整(DTW) 转载

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