fold-change的意义 图中点的意义？

Posted 2023-04-02

fold change倍性变化。

黑点含义：

1、h3k9me3甲基化位点的差异表达倍数。

2、h3k4me3甲基化位点的差异表达倍数。

3、和四个探针组中的某一组结合。

fold-change的意思：

解释：表达值倍数变化 ，分析，消除可能的混杂因素，必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充。

Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度。

1、例如，若初始值为30，最终值为60，则相应的fold change为2，或者可以描述为一个2折的增长。fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到。

2、例如，若初始值为A，最终值为B，则fold change为B/A。

3、再举一个例子，从80变到20，则fold change为0.25，反之，20变到80的fold change为4。一些开发值将小于1的fold change替换为对应的负数。

4、例如，从80变到20时，认为fold change为-4（即负4折）。

fold change经常用于微阵列芯片和RNA序列实验的基因表达数据分析，用来度量基因的表达水平。

参考技术A fold-change 是差异表达倍数值，图中（log2）取fold-change的log2值，总的来说这张图表示了两个组蛋白甲基化修饰位点在四个探针组下（四个角上的框）的差异表达情况，在0十字交叉线上的说明至少一种没差别，但是两种同时没有差别的也没有，所以十字交叉处是没有点的，一般2倍以上算是差异显著，黑点在坐标上的含义同时包含了三个信息，1: h3k9me3甲基化位点的差异表达倍数，2：h3k4me3甲基化位点的差异表达倍数，3：和四个探针组中的某一组结合 参考技术B fold change倍性变化

基因芯片或者高通量测序结果中的log2 fold change和q-value，分别表示啥意义？

RT。

基因芯片结果fold-change>1.5 有意义。

log2 fold change：其实端粒也是DNA，只不过端粒是染色体头部和尾部重复的DNA。把端粒当作一件绒线衫，袖口脱落的线段，绒线衫像是结构严密的DNA。

q-value：细胞学家从来不对染色体棒尾巴拖出的DNA感兴趣。他们把注意力聚集在46条染色的基因图上面，而且把绘制的人类基因组草图的事大声喧哗。 1990年起Calvin Harley把端粒与人体衰老挂上了钩。他讲了三点，将它记录如下：

细胞愈老，其端粒长度愈短；细胞愈年轻，端粒愈长，端粒与细胞老化有关系。衰老细胞中的一些端粒丢失了大部分端粒重复序列。当细胞端粒的功能受损时，出现衰老。而当端粒缩短至关键长度后，衰老加速，临近死亡。

扩展资料：

基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上，所以可以一次性对样品大量序列进行检测和分析，从而解决了传统核酸印迹杂交（Southern Blotting 和 Northern Blotting 等）技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足。

而且，通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使该技术具有多种不同的应用价值，如基因表达谱测定、突变检测、多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等。

参考资料来源：百度百科-基因芯片

参考技术A 1，fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数，log2 fold change的意思是取log2，这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距。
2，Q-value，是P-value校正值，P值是统计差异的显著性的。Q值比P值更严格的一种统计。本回答被提问者和网友采纳 参考技术B 佳学基因应该知道追问

加血基因是谁啊