利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度

Posted Mario cai

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

# Import libraries
from Bio import pairwise2
from Bio.Seq import Seq
 
# Creating sample sequences
seq1 = Seq("TGTGACTA")
seq2 = Seq("CATGGTCA")
 
# Finding similarities
alignments = pairwise2.align.globalxx(seq1, seq2)
 
# Showing results
for match in alignments:
    print(match)

Biopython - Pairwise Alignment - GeeksforGeeks

以上是关于利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章