利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度
Posted Mario cai
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
# Import libraries
from Bio import pairwise2
from Bio.Seq import Seq
# Creating sample sequences
seq1 = Seq("TGTGACTA")
seq2 = Seq("CATGGTCA")
# Finding similarities
alignments = pairwise2.align.globalxx(seq1, seq2)
# Showing results
for match in alignments:
print(match)
Biopython - Pairwise Alignment - GeeksforGeeks
以上是关于利用Biopython – Pairwise Alignment计算序列相似度的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章