R在linux中的library path的问题：

Posted 2023-02-26

参考技术A 问题：

非root权限下安装的R包都是默认安装在

/home/[yourname]/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/[version]

这就导致一个问题，别的用户无法使用到你安装的包，需要自己再安装一遍，这样就很麻烦

解决办法：将别人的R library path 加载到自己的R环境变量中就可以了：

先查看一下包的安装路径：

.libPath()

[1] "/home/user2/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1"

[2] "/usr/local/lib/R/site-library"

[3] "/usr/lib/R/site-library"

[4] "/usr/lib/R/library"

安装时会按照顺序安装，

[1] "/home/balter/conda/envs/dada2/lib/R/library" "/usr/local/lib/R/site-library"

[3] "/usr/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/library"

export R_LIBS="/home/user2/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1"

即可凑合用。

更专业点就是修改R启动时候加载的Rprofile文件，参考：

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html