R语言-环境变量设置

Posted 2023-04-23

参考技术A 设置环境变量的函数为options()，用options()命令可以设置一些环境变量，使用help(options)可以查看详细的参数信息。

1. 数字位数的设置

2. 扩展包的安装，修改默认安装镜像。

3. 利用R里的options函数进行光标和数字位数设置。

4. R里的options函数进行错误信息显示（忽略）设置。

5. options()常用于设置R控制台、R语言计算相关的属性，常用属性名称及默认值如下：

6. 设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径

关于R启动（help(Startup)）和选项（help(options)）的内容，参见R帮助页面。

参考：
https://www.cnblogs.com/cloudtj/articles/5467922.html

R - 永久设置环境变量

【中文标题】R - 永久设置环境变量

【英文标题】：R - Set environment variable permanently

【发布时间】：2018-09-19 04:24:44

【问题描述】：

我想为我的 Reticulate 包设置默认的 Python 发行版。我用，

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "/usr/local/bin/python3")

但是，我每次启动 R 时都必须重新输入这行代码。我怎样才能永久设置它，这样我就不需要每次都指定我需要哪个 Python 发行版？

【问题讨论】：

将该行添加到您的 RProfile

我做了，还是不行

您还有其他 Rprofile 内容吗？是在启动时加载的吗？ .Rprofile 应位于此处：Sys.getenv("R_USER")

Sys.getenv("R_USER") 返回 ""（空白）

我会尝试创建一个名为.Rprofile 的文件并将其放入您的工作目录中。将此行：.First <- function() cat("\014\ntesting\ntesting") 添加到文件中。如果您的 R 配置文件正在加载，它将在启动时将“测试测试”打印到控制台。如果这不起作用，Google 就是你的朋友。

【参考方案1】：

packge usethis 有一个功能可以打开你的 home 文件夹的文件 .Renviron。

usethis::edit_r_environ()

打开文件后，您只需添加您的键=值对，保存并关闭它。

RETICULATE_PYTHON=/usr/local/bin/python3

【参考方案2】：

在 Windows 上，使用Sys.getenv('R_USER') @Brian Davis 在 cmets 中的建议来了解您的主文件夹的位置。在 Linux 上，Sys.getenv('HOME') 应该是您应该使用的正常主文件夹。

现在打开一个终端（如果您使用的是最新版本的 Rstudio，控制台旁边有一个），转到您的主文件夹并添加一个 .Renviron 文件。您也可以在不使用终端的情况下执行此操作，但您可能必须确认创建以点开头的文件。

cd path_to_my_home_Folder
touch .Renviron

在其中添加RETICULATE_PYTHON = /usr/local/bin/python3，并在末尾添加一个新行。您的文件应如下所示（如果是新文件）：

> RETICULATE_PYTHON = /usr/local/bin/python3

现在您应该能够在每个 R 会话中使用 Sys.getenv('RETICULATE_PYTHON') 访问您的环境变量，因为 R 在启动时会在 R 主文件夹中查找定义环境变量的任何 .Renviron 文件（请参阅有关 startup?Startup 的文档）。

2018 年 10 月 29 日更新

事实证明，使用 .Renviron 定义的变量仅在 Rstudio 中可用，这并不奇怪，因为在 Rstudio 启动时会读取 .Renviron 文件。如果您希望环境变量可用于Rscript（例如），您可以：

Windows 使用Modify environment variables 实用程序（在开始菜单搜索栏中可用）将其添加到您的用户环境变量中

Mac 您可以执行与上述完全相同的过程，但在您的 .bash_profile 上执行此操作，而不是在 .Rstudio 上执行。打开一个终端并将自己放置到您的用户根文件夹（通常是终端的默认位置）。添加以下行（等号周围没有空格）：

export RETICULATE_PYTHON=/usr/local/bin/python3

保存并关闭，重启终端。终端在启动时读取您的.bash_profile，从而定义环境变量。即使在非交互式 R 会话中，您的 RETICULATE_PYTHON 现在也应该可用。