三元相图怎么看怎么画（附R代码示例）

Posted 2023-03-14

参考技术A

三元图是重心图的一种，它有三个变量，但需要三者总和为恒定值。在一个等边三角形坐标系中， 图中某一点的位置代表三个变量间的比例关系 。在群体遗传学中，它被称做Finetti图；在博弈论中，常被称为simplex图。

在高通量测序分析领域中，最常用的是两组间的比较，展示的方式有火山图、曼哈顿图等，而三组互相两两比较需要展示三个图吗？就没有更好的展示方式了吗？三元图的引入解决了这一问题。近年来，常用于展示三组间的相对基因表达或OTU丰度，即美观，又有意义。

常用三角形来表示三元合金的成分，这样的三角形称为浓度三角形或成分三角形（CompositionTriangle）。常用的成分三角形是等边三角形和直角三角形以及等腰三角形。是应用最为广泛的还是等边三角形，这里也主要介绍等边三角形的三元相图。

如图所示：
oa+ob+oc=AB=BC=CA
由于oa=bC=WA
ob=Ac=WB
oc=Ba=WC
因此，可用
oa代表A组元的含量，
ob代表B组元的含量，
oc代表C组元的含量。

所以你需要画一个等边三角形还模拟一下，需要注意的是箭头的方向，还有就是三角形是等边的很是对称，所以要把字母标好。相信我，你会乱的，然后就好了。

垂线法：点向三条边做垂线，穿越的格数，即对角组中所占比例；
向各边零坐标方向作平行线法：按坐标系组的颜色和数值直接读各组比例；

当然，我们就介绍集中R做的三元相图。

用来作图的数据是这样的：

喜欢（习惯）ggplot的朋友可能会更加喜欢ggtern包。它是基于ggplot2的，参数设置方面也是一致的。

如果变量较多可采用核密度估算，并使用轮廓显示结果.

如果你想一步一步地构建一个三元相图那么Ternary也许是一个不错的选择。

Ternary plot
百科三元相图
扩增子图片解读7三元图：美的不要不要的，再多用也不过分
Creating ternary plots with Ternary
DRAFT Triad Data Visualizations: Part 1
Legends (ggplot2)