sh 提取所有FASTQ标头

Posted

tags:

篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了sh 提取所有FASTQ标头相关的知识，希望对你有一定的参考价值。

IFS=$'\n'
for line in `cat fastq_list.tsv`; do
    zcat $line | head -n 1 | awk -v fname=$line -v OFS="\t" '{ print $0, fname}' >> fastq_headers.tsv
done

以上是关于sh 提取所有FASTQ标头的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章