sh 有用的nextflow bash函数

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了sh 有用的nextflow bash函数相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

# Shortcut for going to work directories
# Usage: gw <workdir pattern>
# Replace the work directory below as needed
# Where workdir pattern is something like "ab/afedeu"
function gw {
        path=`ls --color=none -d /path/to/work/directory/$1*`
        cd $path
}

# sq squeue alternative
# Outputs more complete information about jobs including the work directory
function sq() {
    squeue --user `whoami` --format='%.18i %50j %10u %.10C %m %20J %M %.2t %n %R %Z' | awk -v OFS='\t' '{ match($10, /([a-f0-9]{2}\/[a-f0-9]{6})/, arr); print $1, $2, $3, $4, $5, $6, $7, $8, $9, arr[1] }' 
}

以上是关于sh 有用的nextflow bash函数的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

sh 有用的bash别名或命令

sh bash有用的命令

sh 和 Bash 的区别

是否可以在单个 nextflow 过程中对输入进行输出反馈?

为啥 Nextflow 不能处理这个 awk 短语?

.sh 文件的 Git bash 选项卡完成