通过命令行安装二进制压缩 R 包

Posted 2023-02-25

【中文标题】通过命令行安装二进制压缩 R 包

【英文标题】：Install binary zipped R package via command line

【发布时间】：2011-10-27 21:22:04

【问题描述】：

我正在尝试通过命令行在 Windows 7 机器上安装压缩的二进制 R 包

R CMD INSTALL packagename

但它不起作用。我读到 CMD INSTALL 不能用于安装二进制包。那么如何通过命令行安装二进制包呢？

【参考方案1】：

您可以使用Rscript 前端来运行代码，就像它在正在运行的 R 会话中一样。假设您要安装的软件包是当前工作目录中的foo.zip。我可能在这里滥用Rscript，但它对我有用：

Rscript -e "install.packages('foo.zip', repos = NULL)"

如果二进制包不在运行脚本的目录中，则需要提供二进制包的路径。 repos = NULL 是让 install.packages() 从本地文件工作的技巧。阅读?install.packages 以获取有关您可能想要指定的其他参数的更多信息，尤其是lib。请注意，执行此操作时您不会从自动依赖解析中受益 - 您需要一个 repo，如果您提供一个，R 将尝试下载包。

R CMD INSTALL 是对的； R 安装和管理手册在Section 6.3 中有以下内容：

在类 Unix 中从源代码安装包

    R CMD INSTALL -l /path/to/library pkg1 pkg2 ...

【参考方案2】：

对于像我这样的新手来说，一个没有麻烦的替代方案是：

 install.packages(file.choose(), repos=NULL)

file.choose() 命令将显示一个窗口，您可以选择下载的 .zip 文件或 tar.gz 文件。 当您在 Windows 机器上没有足够的权限并像我这样从闪存驱动器运行 R 时，此命令非常有用。

在运行此命令之前将您要安装的 zip 文件重命名为您打算使用的包名称也很有用。

【讨论】：

这是 RStudio 中唯一对我有用的东西

【参考方案3】：

对@moldovean 的回答的补充： 我曾经保存压缩文件（从 temp 复制到 R 下载文件夹以供将来参考）。 当我将 R 从 2.15.1 更新到 3.0.1 时，我运行这些命令以便于安装：

setwd("C:/Downloads/R Packages");
packages<-dir();
install.packages(x, repos=NULL) #where x is the name of package

R 会自动从压缩文件中安装所有软件包。现在我可以只用一个命令更新所有这些（谷歌它）

【讨论】：

我认为这可能并不完全安全，因为这些软件包是在以前版本的 R ... 下构建的？ （我可能是错的，我希望这样会更方便。）在你这样做之后，你应该运行update.packages(ask=FALSE,checkBuilt=TRUE)，如果你有很多包，这可能需要一段时间......