AttributeError：模块“networkx”没有属性“from_pandas_dataframe”

Posted 2023-02-16

【中文标题】AttributeError：模块“networkx”没有属性“from_pandas_dataframe”

【英文标题】：AttributeError: module 'networkx' has no attribute 'from_pandas_dataframe'

【发布时间】：2018-08-19 18:06:39

【问题描述】：

我有networkx v. 2.1。为了使其与 pandas 数据框一起工作，我尝试了以下操作：

通过pip3 安装，这不起作用生成Atrribute Error，如标题，因此被卸载。 用“python3 setup.py install”重新安装

错误描述。

AttributeError: 模块 'networkx' 没有属性 'from_pandas_dataframe`

重现错误的步骤：

我使用csv 导入数据。我这样做是因为我只想从数据集中读取 5000 行。

x=pd.DataFrame([x for x in rawData[:5000]])

x[:10] 

0   1   2
0   228055  231908  1
1   228056  228899  1
2   228050  230029  1
3   228059  230564  1
4   228059  230548  1
5   70175   70227   1
6   89370   236886  1
7   89371   247658  1
8   89371   249558  1
9   89371   175997  1

g_data=G=nx.from_pandas_dataframe(x)

module 'networkx' has no attribute 'from_pandas_dataframe'

我知道我错过了from_pandas_dataframe，但找不到安装它的方法。

[m for m in nx.__dir__() if 'pandas' in m] 

['from_pandas_adjacency',
 'to_pandas_adjacency',
 'from_pandas_edgelist',
 'to_pandas_edgelist']

【参考方案1】：

在networkx 2.0 from_pandas_dataframe has been removed.

您可以改为使用from_pandas_edgelist。

那么你将拥有：

g_data=G=nx.from_pandas_edgelist(x, 1, 2, edge_attr=True)

【讨论】：

我用的是pip install networkx但只得到了没有from_pandas_edgelist的1.11，然后我尝试了pip install --upgrade networkx，最后得到了from_pandas_edgelist

无向图怎么样？

【参考方案2】：

一个简单的图表：

import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

# Build a dataframe with 4 connections
df = pd.DataFrame('from': \['A', 'B', 'C', 'A'\], 'to': \['D', 'A', 'E', 'C'\])

# Build your graph
G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'from', 'to')

# Plot it
nx.draw(G, with_labels=True)
plt.show()

【参考方案3】：

这个solution 也有帮助：

G = nx.DiGraph()
G.add_weighted_edges_from([tuple(x) for x in x.values])
nx.info(G)


'Name: \nType: DiGraph\nNumber of nodes: 5713\nNumber of edges: 5000\nAverage in degree:   0.8752\nAverage out degree:   0.8752'

【讨论】：

这与答案无关