在 ggplot 中使用 NA 值创建连续折线图并添加辅助 y 轴

Posted 2023-02-16

【中文标题】在 ggplot 中使用 NA 值创建连续折线图并添加辅助 y 轴

【英文标题】：Creating continuous line graph in ggplot with NA values and adding secondary y axis

【发布时间】：2021-11-25 08:52:54

【问题描述】：

我想创建一个连续的时间序列折线图。但是，我的数据中有NA 值，因此典型的输出是不连续的。我尝试使用na.omit 参数，但出现错误

charToDate(x) 中的错误：字符串不在标准中 明确的格式”

这是我的脚本：

test <- read.csv(
  file=paste0("testdata.csv"),
  stringsAsFactors = FALSE)

test$Date <- as.Date(test$Date)

ggplot(na.omit(test), aes(x=Date, y=A))+
  geom_line(na.rm=TRUE)+
  xlab("") + ylab("A")+
  (scale_x_date(breaks=date_breaks("1 month"),labels=date_format("%b")))+
  scale_y_continuous(expand = c(0, 0), limits = c(28, 31))+
  geom_point(shape=1)+
  theme_bw()

除此之外，我还想在同一个图中创建第二个 y 轴。我使用了sec.axis 参数。该轴的数据也有NA 值。但是，由于脚本的第一部分有问题，我无法确认我的代码是否有效。这是附加代码：

  geom_line(aes(y = B/20, colour ="B")) +
  scale_y_continuous(expand=c(0,0), sec.axis = sec_axis(~.*20, bquote(B)))+
    geom_point(shape=0)

这是我的一部分数据

Date	A	B
2020-09-23	28.2	NA
2020-09-30	NA	0.192
2020-10-01	28.4	NA
2020-10-07	28.6	NA
2020-10-14	28.8	NA
2020-10-21	28	NA
2020-10-28	NA	0.136
2020-11-01	28.5	NA
2020-11-04	27.6	NA
2020-11-11	27.9	NA
2020-11-18	27.9	NA
2020-11-25	NA	0.184
2020-12-01	28.1	NA
2020-12-02	28.4	NA
2020-12-09	29	NA

【参考方案1】：

我不确定这就是你想要的那部分数据B 有很多NA。

评论：如果na.omit 对部分数据，没有任何剩余，所以我无法继续使用na.omit。

test2 <- test %>% mutate(Date = as.Date(Date))

test3 <- test2 %>%
  select(Date, A) %>%
  na.omit 

test3 %>%
  mutate(Date = as.Date(Date)) %>%
  ggplot(aes(x=Date, y=A))+
  geom_line(na.rm=TRUE)+
  xlab("") + ylab("A")+
  (scale_x_date(breaks=date_breaks("1 month"),labels=date_format("%b")))+
  scale_y_continuous(expand = c(0, 0), limits = c(28, 31))+
  geom_point(shape=1)+
  theme_bw() +
  geom_line(data = test2, aes(x = Date,y = B/20, colour ="B")) +
  scale_y_continuous(expand=c(0,0), sec.axis = sec_axis(~.*20, bquote(B)))+
  geom_point(shape=0,data = test2,aes(y = B* 20, colour ="B"))

【讨论】：

嗨@Park！是的，数据只是更大数据集的一部分，所以有很多 NA。你知道我可以如何连接数据点，这样它们就不会只是点/不连续的吗？

@okscientist 恐怕你不能让每个点都连续。我编辑我的代码以使A 连续