ggplot2 密度与密度函数有何不同？

Posted 2023-02-16

【中文标题】ggplot2 密度与密度函数有何不同？

【英文标题】：How does ggplot2 density differ from the density function?

【发布时间】：2016-08-15 09:00:18

【问题描述】：

为什么下面的图看起来不同？这两种方法似乎都使用高斯核。

ggplot2 如何计算密度？

library(fueleconomy)

d <- density(vehicles$cty, n=2000)
ggplot(NULL, aes(x=d$x, y=d$y)) + geom_line() + scale_x_log10()

ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + geom_density() + scale_x_log10()

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更新：

这个问题的解决方案已经出现在 SO here 上，但是 ggplot2 传递给 R stats 密度函数的具体参数仍不清楚。

另一种解决方案是直接从 ggplot2 图中提取密度数据，如图所示here

【问题讨论】：

感谢您的参考。但是，该解决方案似乎无法识别显式参数差异。我想知道如何从 ggplot 密度中生成/提取精确的密度数据。

这似乎提取了 geom_density 图的确切值：***.com/questions/12394321/…

我不认为这与密度有关，而是您如何应用日志转换

我可以应用替代日志转换来使它们相同吗？

例如尝试d2 <- density(log10(vehicles$cty), from=min(log10(vehicles$cty)), to=max(log10(vehicles$cty))) ; ggplot(data.frame(x=d2$x, y=d2$y), aes(x=x, y=y)) + geom_line() ：但您需要调整轴标签。 Ansggplot(vehicles, aes(x=cty)) + stat_density(geom="line") + scale_x_log10()

【参考方案1】：

在这种情况下，不同的不是密度计算，而是如何 应用 log10 变换。

首先检查密度是否相似，没有变换

library(ggplot2)
library(fueleconomy)

d <- density(vehicles$cty, from=min(vehicles$cty), to=max(vehicles$cty))
ggplot(data.frame(x=d$x, y=d$y), aes(x=x, y=y)) + geom_line() 
ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + stat_density(geom="line")

所以问题似乎是转换。在下面的stat_density 中，它似乎是 如果在密度计算之前将 log10 变换应用于 x 变量。 因此，要手动重现结果，您必须在 计算密度。例如

d2 <- density(log10(vehicles$cty), from=min(log10(vehicles$cty)), 
                                               to=max(log10(vehicles$cty)))
ggplot(data.frame(x=d2$x, y=d2$y), aes(x=x, y=y)) + geom_line() 
ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + stat_density(geom="line") + scale_x_log10()

PS：要了解ggplot如何为密度准备数据，您可以查看代码as.list(StatDensity)导致StatDensity$compute_group到ggplot2:::compute_density