如何读取具有动态名称的文件，同时避免在 R 中进行硬编码？

Posted 2023-02-23

【中文标题】如何读取具有动态名称的文件，同时避免在 R 中进行硬编码？

【英文标题】：How to read in file with dynamic name while avoiding hard-coding in R?

【发布时间】：2020-01-30 05:46:36

【问题描述】：

我在读取具有动态名称的 csv 文件时遇到问题并且避免对文件路径进行硬编码。我想要简洁的代码（非硬编码）。如果我对完整路径（“~”之前的所有内容）进行硬编码，它可以很好地读取文件。但是软编码（如果这与硬编码相反）它给出错误的文件路径（尽管在错误中显示了正确的路径。我有两个可变部分的文件名，我在阅读之前粘贴到文件名中在。如果我避免粘贴，只为每个人输入一个路径，它也可以工作。

#dynamic part I usually have in a loop with all the options. 
part_a <- "outside" #other options here in my loop include "inside"
part_b <- "late" # other option "early" or "preterm"

#reading in the df
df <-read.csv(paste0("~/Data/FromR/clean_",part_a,part_b,"_2016.csv"),
                           check.names=FALSE, na.strings="null")

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
    In addition: Warning message:
    In file(file, "rt") :
      cannot open file 'C:/Users/myname/Documents/Data/FromR/clean_outsidelate_2016.csv': No such file or directory

如果我按照建议的here 在粘贴的第一部分使用getwd() 代替~，它可以通过在粘贴开始时生成此字符串"C:/Users/myname/Documents/MyR_Projects/Specific_R_project/" 来工作。但是我怎样才能让它与“〜”一起工作？使用~ 时，它会停在“Documents”文件夹...

期望的结果是正确读取文件并执行功能并与其他文件重复。我的循环可以很好地硬编码，我只想让它更通用或软编码。

【问题讨论】：

请包括预期输出。您是否要读取两个文件？

getwd() 返回什么？

我更新了问题。现在要解决的问题涉及要读入的单个文件。getwd() 返回工作目录路径中的所有内容，正如我在问题中更正的那样。

【参考方案1】：

我刚刚尝试从另一个 wd 读取我家中的文件 (testFile.txt)，它与 ​​~ 一起工作正常

 myFile <- "testFile
 mymy <- ".txt"
 ciao <- read.delim(paste0("~/",myFile,mymy))

在powershell中你可以使用%~%（看看这里tread），但我不知道如何在R中扩展$HOME。

#-------- edit

看看here 和here。基本上，.Renviron 中定义的任何变量都应该可以访问。

【讨论】：

修复了我的问题，使其具有正确的文件名。有哪些资源可以检查单个字符符号的处理方式，例如~？