在 Swig 中通过 ref 返回动态数组
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【中文标题】在 Swig 中通过 ref 返回动态数组【英文标题】:Return dynamic arrays by ref in Swig 【发布时间】:2016-07-06 10:48:33 【问题描述】:我正在使用 swig 在 c++ 中包装一些代码以在 Python 中使用。 在对输入数组进行一些计算后,我有一个获取数组并返回 2 个动态数组(该函数通过 ref 获取它们)的函数。 我的问题是输出数组的大小未指定,因为大小取决于输入数组。 我的功能看起来像:
void arrayManipulate(int* inArray, int inLen, int resolution, int* &outArray1, int &outLen1, int* &outArray2, int &outLen2)
我使用 numpy.i 将输入数组转换为 numpy 数组。 但是如果我想使用 numpy 来返回带有 ARGOUT 的数组,它就不起作用,因为它假设输出数组的大小是已知的。
模块.i:
%module minimal
%
#include "minimal.h"
#include "numpy/arrayobject.h"
%
%include numpy.i
%init %
inport_array();
%
%apply (int* INARRAY1, int DIM1) (int* inArray, int inLen)
%apply (int* ARGOUT_ARRAY1, int DIM1) (int* &outArray1, int &outLen1), (int* &outArray2, int &outLen2)
%include "minimal.h"
如果我尝试编译它,我会收到以下错误:
File minimal_wrap.cxx: IntelliSense: a value of type "int" could not be assigned to entity od type "int *"
File minimal_wrap.cxx: IntelliSense: a value of type "int *" could not be assigned to entity od type "int **"
如果我从 minimum.i 和 minimum.h(从函数)中删除所有“&”符号,它会编译,但 python 除外以给出输出数组的维度:
TypeError: arrayManipulate takes exactly 4 arguments (2 given)
我想在 python 中使用它,例如:
import minimal
import numpy as np
arr1, arr2 = minimal.arrayManipulate(np.asarray([1,2,3]),100)
我怎样才能让它工作?
【问题讨论】:
看来您需要ARGOUTVIEW_ARRAY1
类型映射。
将您的签名更改为(int* inArray, int inLen, int resolution, int** outArray1, int* outLen1, int** outArray2, int *outLen2)
并使用ARGOUTVIEW_ARRAY1
甚至更好的ARGOUTVIEWM_ARRAY1
。返回一个带有托管数据的 NumPy 数组。
【参考方案1】:
这里有一个答案,它使用双指针而不是 *&。你可以制作一个简单的包装函数来支持这个原型
请注意,返回的数组是分配的,并且类型映射会生成一个代理,以确保在 Python 中删除数组时删除。它们是受管理的
头文件(test.h):
#pragma once
void fun(int* inArray, int inLen, int resolution,
int** outArray1, int* outLen1,
int** outArray2, int* outLen2);
源文件(test.cpp):
#include "test.h"
#include <malloc.h>
void fun(int* inArray, int inLen, int resolution,
int** outArray1, int* outLen1,
int** outArray2, int* outLen2)
int _outLen1 = resolution*inLen;
int _outLen2 = resolution*inLen;
int* _outArray1 = (int*)malloc(_outLen1*sizeof(int));
int* _outArray2 = (int*)malloc(_outLen2*sizeof(int));
for (int i = 0 ; i < inLen ; i++)
for (int j = 0 ; j < resolution ; j++)
_outArray1[i*resolution+j] = resolution*inArray[i];
_outArray2[i*resolution+j] = resolution*inArray[i];
// Assign outputs
*outLen1 = _outLen1;
*outLen2 = _outLen2;
*outArray1 = _outArray1;
*outArray2 = _outArray2;
接口定义文件(test.i)
%module example
%
#define SWIG_FILE_WITH_INIT
#include "test.h"
%
%include "numpy.i"
%init
%
import_array();
%
%apply (int* IN_ARRAY1, int DIM1) (int* inArray, int inLen)
%apply (int** ARGOUTVIEWM_ARRAY1, int* DIM1) (int** outArray1, int* outLen1)
%apply (int** ARGOUTVIEWM_ARRAY1, int* DIM1) (int** outArray2, int* outLen2)
%include "test.h"
在 Python 中
import numpy as np
import example
a = np.ones(27,dtype=np.int32)
h = example.fun(a,2) # h contains the two outputs
为了支持例如size_t,在 numpy.i 中搜索此部分
%numpy_typemaps(unsigned long long, NPY_ULONGLONG, int)
%numpy_typemaps(float , NPY_FLOAT , int)
%numpy_typemaps(double , NPY_DOUBLE , int)
并添加以下内容
%numpy_typemaps(signed char , NPY_BYTE , size_t)
%numpy_typemaps(unsigned char , NPY_UBYTE , size_t)
%numpy_typemaps(short , NPY_SHORT , size_t)
%numpy_typemaps(unsigned short , NPY_USHORT , size_t)
%numpy_typemaps(int , NPY_INT , size_t)
%numpy_typemaps(unsigned int , NPY_UINT , size_t)
%numpy_typemaps(long , NPY_LONG , size_t)
%numpy_typemaps(unsigned long , NPY_ULONG , size_t)
%numpy_typemaps(long long , NPY_LONGLONG , size_t)
%numpy_typemaps(unsigned long long, NPY_ULONGLONG, size_t)
%numpy_typemaps(float , NPY_FLOAT , size_t)
%numpy_typemaps(double , NPY_DOUBLE , size_t)
这添加了更多类型映射以支持使用 size_t 而不是 int 进行索引。
【讨论】:
这对我有用。谢谢你。如果我希望维度参数 (outLen1) 的类型与大型数组的 int - long 或 size_t 不同,我该怎么做? 在numpy.i中添加几行。所有类型映射都是使用宏创建的。查看文件以上是关于在 Swig 中通过 ref 返回动态数组的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
通过动态分配创建数组后,在C中通过realloc改变内存大小时出现问题