带有 Rcpp 头文件的 c++ 文件的编译步骤

Posted 2023-02-22

【中文标题】带有 Rcpp 头文件的 c++ 文件的编译步骤

【英文标题】：Compilation steps for a c++ file with Rcpp header file

【发布时间】：2018-06-29 04:20:07

【问题描述】：

我正在 gedit 上尝试此代码，并在终端上通过 g++ 编译器进行编译。

#include <Rcpp.h>

using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
double sumC(NumericVector x) 
  int n = x.size();
  double total = 0;

  for(int i = 0; i < n; ++i) 
    total += x[i];
  
  return total;


// [[Rcpp::export]]
double meanC(NumericVector x) 
  return sumC(x) / x.size();

头文件发生错误。

致命错误：Rcpp.h：没有这样的文件或目录

我是这样编译的：g++ -I /usr/ r1.cpp -o c0 -L /usr/ -lRcpp 我也试过：g++ -I /usr/lib/R/site-library/Rcpp/include/ r1.cpp -o c0 -L /usr/lib/R/site-library/Rcpp/libs/ -lRcpp 。然后得到像致命的错误

error: R.h: No such file or directory #include <R.h>

Locations:
 locate Rcpp.h:/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include/Rcpp.h
 locate R.h:/usr/share/R/include/R.h

我也尝试过制作文件。 我的制作文件：

all:
    g++ rcpp.cpp -o obj
compile: 

我已将所有依赖的头文件附加到一个文件夹中。仍然收到 Rcpp 的错误。

有人知道如何通过终端编译吗？

【问题讨论】：

您是否正在尝试将此 C++ 文件编译成可以运行的程序？如果没有main()，那将无法工作。除此之外yesterday’s answer 仍然适用。

:***.com/questions/45296381/….

在那个问题中，来自 Rcpp 的帮助函数用于编译和链接上述 C++ 文件并将其加载到正在运行的 R 进程中。这一切的预期结果是什么？

我担心你会继续误解如何它是如何工作的以及如何它应该被使用。从 R，在这两种情况下。也许尝试查看更新后的Rcpp Introduction。

【参考方案1】：

你可以编译这个文件

g++ -I/usr/share/R/include -I/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include -c rcpp.cpp -o rcpp.o

但是，我不明白您为什么要这样做。为了使此类 C++ 函数可以从 R 中调用，还需要几个额外的步骤：

C++ 包装函数转换为基于 R 的SEXP 的接口。 通过 .Call() 调用 C++ 包装函数的 R 包装函数。 将所有目标文件链接到 R 可以加载的动态库中。 将库和 R 包装函数加载到 R 中。

所有这些都是通过 sourceCpp() 或在使用 Rcpp 的包的上下文中使用 Rcpp::compileAttributes() 时自动化的，c.f. attributes 和 packages 上的小插曲。

【讨论】：

我是这个领域的新手，第一次尝试从 Cpp 调用 R 函数。

g++ -I/usr/share/R/include -I/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include -c rcpp.cpp -o rcpp.o i> 这将创建一个 rcpp.o 文件。该文件是编译和链接之间的目标文件。它不能用 ./rcpp.o

执行

@Aswathy 是的，这是命令的结果。这是一个陈述还是一个（隐藏的）问题？

：它的工作并创建一个目标文件。但也需要创建 -L 用于链接。我认为只有我可以将目标文件转换为可执行文件。

@9113303 如果您想要一个可以直接调用的可执行文件，那么您将不得不做更多的事情。 RInside 对此有所帮助。一旦您解释了您要做什么，我们也可以帮助您。见How to Ask。