如何在python中执行逻辑套索?
Posted
技术标签:
【中文标题】如何在python中执行逻辑套索?【英文标题】:How to perform logistic lasso in python? 【发布时间】:2017-05-29 02:49:09 【问题描述】:scikit-learn 包提供了 Lasso()
和 LassoCV()
函数,但没有选项可以拟合逻辑函数而不是线性函数...如何在 python 中执行逻辑套索?
【问题讨论】:
我仍然没有答案。我最终使用包 glmnet 在 R 中执行了这个分析。 【参考方案1】:Lasso 使用 L1 惩罚优化最小二乘问题。 根据定义,您无法使用 Lasso 优化逻辑函数。
如果您想优化带有 L1 惩罚的逻辑函数,您可以使用带有 L1 惩罚的 LogisticRegression
估计器:
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.datasets import load_iris
X, y = load_iris(return_X_y=True)
log = LogisticRegression(penalty='l1', solver='liblinear')
log.fit(X, y)
请注意,只有 LIBLINEAR 和 SAGA(在 v0.19 中添加)求解器处理 L1 惩罚。
【讨论】:
套索不仅用于最小二乘问题。任何似然惩罚(L1 或 L2)都可以与任何似然公式模型一起使用,其中包括使用指数族似然函数建模的任何广义线性模型,其中包括逻辑回归。 同意。 Lasso 正则化最初是为最小二乘定义的,它很容易扩展到各种统计模型。但在 scikit-learn 中,Lasso
类仅包括最小二乘。其他类包括 L1 正则化(LogisticRegression
、NMF
、...),但它被称为“L1 正则化”,而不是“Lasso”。
啊好的。我以为你一般指的是套索。【参考方案2】:
您可以在 Python 中使用 glment。 Glmnet 使用热启动和活动集收敛,因此非常高效。这些技术使 glment 比其他套索实现更快。可以从https://web.stanford.edu/~hastie/glmnet_python/下载
【讨论】:
【参考方案3】:1 scikit-learn:sklearn.linear_model.LogisticRegression
来自 scikit-learn 的sklearn.linear_model.LogisticRegression
可能是最好的:
因为@TomDLT said,Lasso
是针对最小二乘(回归)情况,而不是逻辑(分类)。
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
model = LogisticRegression(
penalty='l1',
solver='saga', # or 'liblinear'
C=regularization_strength)
model.fit(x, y)
2 python-glmnet:glmnet.LogitNet
您也可以使用Civis Analytics' python-glmnet library。这实现了 scikit-learn BaseEstimator
API:
# source: https://github.com/civisanalytics/python-glmnet#regularized-logistic-regression
from glmnet import LogitNet
m = LogitNet(
alpha=1, # 0 <= alpha <= 1, 0 for ridge, 1 for lasso
)
m = m.fit(x, y)
我不确定如何使用LogitNet
调整惩罚,但我会让你弄清楚。
其他 3 个
PyMC
您也可以采用完全贝叶斯方法。您可以在给定数据的情况下近似系数的分布,而不是使用 L1 惩罚优化来找到系数的点估计。如果您对系数使用拉普拉斯先验,这将为您提供与 L1 惩罚最大似然估计相同的答案。拉普拉斯先验导致稀疏。
PyMC 的人有 a tutorial here 来设置类似的东西。祝你好运。
【讨论】:
以上是关于如何在python中执行逻辑套索?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章