将存储在列表中的数据帧保存到 R 中的单个文件中

Posted 2023-05-07

【中文标题】将存储在列表中的数据帧保存到 R 中的单个文件中

【英文标题】：Saving dataframes stored in a list to individual files in R

【发布时间】：2020-01-21 09:35:57

【问题描述】：

我有一个很大的列表，merged_fin，包含 39 个数据帧。数据集如下所示：

> merged_fin[[1]]
    sourceid dstid       speed
1        177     1 0.010604494
2         46     4 0.010794178
3        100     7 0.007286781

> merged_fin[[2]]
    sourceid dstid       speed
1        721    12 0.013830787
2         23    15 0.016334978
3        274    16 0.015247266
...

我想将该列表中的每个数据集保存到我的工作目录中自己的.rds 文件中。

正在尝试：

for (i in 1:length(merged_fin))
saveRDS(merged_fin[[i]])

或者

saveRDS(merged_fin[[1]])

我收到Error in saveRDS(merged_fin[[i]]) : 'file' must be non-empty string。

正在尝试：

lapply(names(merged_fin), function(i)
  saveRDS(merged_fin[[i]], paste0(i, '.rds')))

我收到list()，但没有文件保存到我的工作目录中。

注意事项： (1)names(merged_fin)输出NULL； (2) 我最初将 merged_fin 编码为一个空列表 (merged fin <- list())，然后用我从不同文件夹中读取的合并数据集填充它。

问题是否在于我引用列表元素的方式？ 是因为最初定义merged_fin 的方式吗？

感谢您的帮助。

解决方案

就我而言，这只是一个命名列表元素的问题，这是 meenaparam 建议的。我有一个包含正确排序的城市名称的向量，称为cities。我刚刚做了names(merged_fin) <- cities，这足以成功运行

lapply(names(merged_fin), function(i)
   saveRDS(merged_fin[[i]], paste0(i, '.rds')))

【参考方案1】：

继上一个答案之后，这里有一个示例，说明如何在 merged_fin 列表中分配并获取数据帧的名称。请注意，如果您的数据框还没有单独的名称，您也可以使用 names(merged_fin) <- c("name1", "name2") 等简单地分配它们。

df1 <- read.table(h=T, text="
                     sourceid dstid       speed
1        177     1 0.010604494
2         46     4 0.010794178
3        100     7 0.007286781")

df2 <- read.table(h=T, text="
                      sourceid dstid       speed
1        721    12 0.013830787
2         23    15 0.016334978
3        274    16 0.015247266")

# make a list of dataframes
merged_fin <- list(df1, df2)

# see that the names of merged_fin are currently set to NULL
names(merged_fin)
#> NULL


# get the names of all the list-type objects in the workspace that contain the string "df" - we do this because dataframes are stored as lists
names_of_dataframes <- ls.str(mode = "list", pattern = "df")
names_of_dataframes
#> df1 : 'data.frame':  3 obs. of  3 variables:
#>  $ sourceid: int  177 46 100
#>  $ dstid   : int  1 4 7
#>  $ speed   : num  0.0106 0.01079 0.00729
#> df2 : 'data.frame':  3 obs. of  3 variables:
#>  $ sourceid: int  721 23 274
#>  $ dstid   : int  12 15 16
#>  $ speed   : num  0.0138 0.0163 0.0152


# assign the dataframe names back to our list of dataframes
names(merged_fin) <- names_of_dataframes
names(merged_fin)
#> [1] "df1" "df2"


# now we can write out the dataframes to files as each dataframe has a name
lapply(names(merged_fin), function(i)
    saveRDS(merged_fin[[i]], paste0("~/Desktop/", i, '.rds')))
#> [[1]]
#> NULL
#> 
#> [[2]]
#> NULL

^{由reprex package (v0.3.0) 于 2020-01-21 创建}

【讨论】：

就我而言，只需将名称添加到列表元素就足以使lapply(names(merged_fin), function(i) saveRDS(merged_fin[[i]], paste0(i, '.rds'))) 工作。谢谢。