Armadillo C++:根据其他两个向量对向量进行排序
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【中文标题】Armadillo C++:根据其他两个向量对向量进行排序【英文标题】:Armadillo C++: Sorting a vector in terms of two other vectors 【发布时间】:2018-03-29 11:25:03 【问题描述】:我的问题与排序练习有关,我可以在 R 中轻松(但可能很慢)进行排序,并希望在 C++ 中进行以加快我的代码速度。
考虑三个大小相同的向量 a、b 和 c。在 R 中,以下命令将首先根据 b 对向量进行排序,然后在出现平局的情况下,将根据 c 进一步排序。
a<-a[order(b,c),1]
例子:
a<-c(1,2,3,4,5)
b<-c(1,2,1,2,1)
c<-c(5,4,3,2,1)
> a[order(b,c)]
[1] 5 3 1 4 2
在 C++ 中使用犰狳向量是否有有效的方法来执行此操作?
【问题讨论】:
在 R 中应该足够快。 这个问题可能对***.com/questions/48118248/…有帮助 【参考方案1】:我们可以编写以下 C++ 解决方案,我在一个文件 SO_answer.cpp
中:
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace arma;
// [[Rcpp::export]]
vec arma_sort(vec x, vec y, vec z)
// Order the elements of x by sorting y and z;
// we order by y unless there's a tie, then order by z.
// First create a vector of indices
uvec idx = regspace<uvec>(0, x.size() - 1);
// Then sort that vector by the values of y and z
std::sort(idx.begin(), idx.end(), [&](int i, int j)
if ( y[i] == y[j] )
return z[i] < z[j];
return y[i] < y[j];
);
// And return x in that order
return x(idx);
我们所做的是利用std::sort()
允许您根据自定义比较器进行排序这一事实。我们使用比较器,仅当y
的元素相等时才比较z
的元素;否则比较y
的值。1 然后我们可以编译文件并在R中测试函数:
library(Rcpp)
sourceCpp("SO_answer.cpp")
set.seed(1234)
x <- sample(1:10)
y <- sample(1:10)
z <- sample(1:10)
y[sample(1:10, 1)] <- 1 # create a tie
all.equal(x[order(y, z)], c(arma_sort(x, y, z))) # check against R
# [1] TRUE # Good
当然,我们还必须考虑这是否真的会给您带来任何性能提升,这就是您这样做的全部原因。让我们进行基准测试:
library(microbenchmark)
microbenchmark(r = x[order(y, z)],
arma = arma_sort(x, y, z),
times = 1e4)
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
r 36.040 37.23 39.386160 37.64 38.32 3316.286 10000 b
arma 5.055 6.07 7.155676 7.00 7.53 107.230 10000 a
在我的机器上,使用小向量时您的速度似乎提高了 5-6 倍,但当您扩大规模时,这种优势就不再存在了:
x <- sample(1:100)
y <- sample(1:100)
z <- sample(1:100)
y[sample(1:100, 10)] <- 1 # create some ties
all.equal(x[order(y, z)], c(arma_sort(x, y, z))) # check against R
# [1] TRUE # Good
microbenchmark(r = x[order(y, z)],
arma = arma_sort(x, y, z),
times = 1e4)
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
r 44.50 46.360 48.01275 46.930 47.755 294.051 10000 b
arma 10.76 12.045 16.30033 13.015 13.715 5262.132 10000 a
x <- sample(1:1000)
y <- sample(1:1000)
z <- sample(1:1000)
y[sample(1:100, 10)] <- 1 # create some ties
all.equal(x[order(y, z)], c(arma_sort(x, y, z))) # check against R
# [1] TRUE # Good
microbenchmark(r = x[order(y, z)],
arma = arma_sort(x, y, z),
times = 1e4)
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
r 113.765 118.7950 125.7387 120.5075 122.4475 3373.696 10000 b
arma 82.690 91.3925 104.0755 95.2350 99.4325 6040.162 10000 a
它仍然更快,但在长度为 1000 的向量处不到 2 倍。这可能是F. Privé 说此操作在 R 中应该足够快的原因。虽然使用 Rcpp 迁移到 C++ 可以为您提供出色的性能优势,您获得收益的程度在很大程度上取决于上下文,正如Dirk Eddelbuettel 在此处回答各种问题时多次提到的那样。
1 请注意,通常我建议使用
sort()
或sort_index()
对犰狳向量进行排序(参见犰狳文档here)。如果您尝试按第二个vec
的值对vec
进行排序,您可以使用x(arma::sort_index(y))
,正如我在对相关问题here 的回答中指出的那样。您甚至可以使用stable_sort_index()
来保持联系。但是,我无法弄清楚如何使用这些功能来解决您在此处提出的具体问题。
【讨论】:
不错的答案。我也没有看到如何使现有的犰狳例程尊重一对以上的向量。 感谢@DirkEddelbuettel!是的,如果您查看 source code,您会发现无法将自定义比较器传递给 Armadillo 排序函数,但您也可以看到它们只是调用std::sort()
,所以我认为这种方法已经足够好了。
谢谢@duckmayr!经过一番思考,另一个解决方案在于,您始终可以定义一个新的向量 d,使其提供与 b 相同的排名,除非出现平局,在这种情况下,您可以让 c 提供的排名发挥作用。您的解决方案更简洁。以上是关于Armadillo C++:根据其他两个向量对向量进行排序的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
armadillo c++:将矩阵的每一行乘以向量的有效而简洁的方法?
Armadillo 与 Boost Odeint 冲突:Odeint 在积分期间将状态向量的大小调整为零