Windows平台下的RcppArmadillo“inDL(x,as.logical(local),as.logical(now),...)中的错误”[关闭]
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【中文标题】Windows平台下的RcppArmadillo“inDL(x,as.logical(local),as.logical(now),...)中的错误”[关闭]【英文标题】:RcppArmadillo "Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)" under Windows Platform [closed] 【发布时间】:2018-10-11 12:35:12 【问题描述】:我有一些像这样用 Rcpp 和 RcppArmadillo 编写的函数
example.cpp:
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <iostream>
#include <math.h>
using namespace Rcpp;
// using namespace RcppArmadillo;
using namespace arma;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
double inner1(NumericVector x, NumericVector y)
int K = x.length() ;
double ip = 0 ;
for (int k = 0 ; k < K ; k++)
ip += x(k) * y(k) ;
return(ip) ;
// [[Rcpp::export]]
mat multiply2(mat A, mat B)
return A * B;
然后我使用Rcpp::sourceCpp('example.cpp')
,它在 Ubuntu 下运行良好。
(我之前跑过library(Rcpp)
和library(RcppArmadillo)
)
但是,当我迁移到 Windows 平台时,RStudio 的 Throw 报错说:
> Rcpp::sourceCpp('R:/example.cpp')
Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) :
unable to load shared object 'C:/Users/[Username]/AppData/Local/Temp/RtmpG6H80X/sourceCpp-x86_64-w64-mingw32-0.12.19/sourcecpp_40b04b2c2bcf/sourceCpp_4.dll':
LoadLibrary failure: The specified procedure could not be found.
我发现关键问题在于矩阵乘法。由于我尝试删除第二个函数multiply2
。那么剩下的代码就可以在windows下编译成功了。
example2.cpp
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <iostream>
#include <math.h>
using namespace Rcpp;
// using namespace RcppArmadillo;
using namespace arma;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
double inner1(NumericVector x, NumericVector y)
int K = x.length() ;
double ip = 0 ;
for (int k = 0 ; k < K ; k++)
ip += x(k) * y(k) ;
return(ip) ;
我尝试了其他一些代码,发现在代码中使用矩阵乘法*
时会出现此错误。
那么,为什么 RcppArmadillo 中的矩阵乘法在 Windows 平台下会失败?
【问题讨论】:
【参考方案1】:折腾了半天编译器,发现关键是我的windows系统环境路径下BLAS
库没有正确设置。
简而言之,解决方案是:
-
在Here下载OpenBLS的预编译二进制包(不要尝试在windows下编译最新版本,我浪费了很多时间)
Exactor
OpenBLAS-v0.2.19-Win64-int32.zip
到 C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32
这样的地方
将C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32\bin
添加到您的PATH
[可选] 创建一个名为BLAS_LIBS
的新环境变量,其值为C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32\bin
重启RStudio,问题解决。
我通过install.packages("RcppArmadillo", type = "source")
从源代码安装RcppArmadillo
找到了这个解决方案,这次RStudio在编译过程中抛出了同样的错误,所以安装失败。
但是,如果我只使用install.packages("RcppArmadillo")
,RStudio 将安装RcppArmadillo
的二进制版本,所以我没有收到任何关于缺少BLAS
的反馈。
【讨论】:
我认为 R 附带的 R 安装和管理 手册中早就描述了一种更简单的方法。以上是关于Windows平台下的RcppArmadillo“inDL(x,as.logical(local),as.logical(now),...)中的错误”[关闭]的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章